27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1385 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1385  hypothetical protein  100 
 
 
53 aa  110  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  97.44 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  53.85 
 
 
89 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  61.54 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  61.54 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  53.85 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  53.85 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  65.79 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  61.29 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  55.88 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0558  hypothetical protein  46.15 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00365448  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0747  hypothetical protein  46.15 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.144242  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  61.54 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  58.97 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  61.54 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  56.41 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0662  hypothetical protein  43.59 
 
 
89 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  56.41 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1409  hypothetical protein  51.28 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.209175  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  53.85 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  53.85 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  51.28 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  51.28 
 
 
75 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2719  hypothetical protein  41.03 
 
 
85 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  52.63 
 
 
89 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  55.26 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>