31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6823 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6823  integrase family protein  100 
 
 		 358 aa  728    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3521  phage integrase  39.02 
 
 		 422 aa  256  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1997  phage integrase  39.88 
 
 		 422 aa  255  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.559264  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1902  phage integrase  40.06 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183596  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3313  phage integrase family protein  37.46 
 
 		 430 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3428  phage integrase protein  35.82 
 
 		 440 aa  202  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0192  integrase family protein  35.5 
 
 		 461 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2329  phage integrase family protein  34.97 
 
 		 454 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0957732  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1310  hypothetical protein  31.62 
 
 		 438 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  30.53 
 
 		 473 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  30.97 
 
 		 490 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  26.6 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3509  putative phage integrase family protein  28.86 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0788  Phage integrase  26.91 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3553  phage integrase  24.01 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.631113  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  27.69 
 
 		 401 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  22.81 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  33.13 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  32.93 
 
 		 409 aa  53.1  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  33.56 
 
 		 434 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  27.22 
 
 		 430 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  22.35 
 
 		 499 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  24.48 
 
 		 381 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  24.11 
 
 		 566 aa  46.6  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1842  putative phage integrase family protein  27.1 
 
 		 113 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  25.19 
 
 		 253 aa  44.3  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  26.14 
 
 		 581 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0255  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.21 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0225677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  24.14 
 
 		 509 aa  43.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  22.59 
 
 		 635 aa  42.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>