34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0192 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0192  integrase family protein  100 
 
 		 461 aa  951    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2329  phage integrase family protein  51.29 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0957732  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1997  phage integrase  35.76 
 
 		 422 aa  243  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.559264  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3313  phage integrase family protein  36.24 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3521  phage integrase  36.41 
 
 		 422 aa  231  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1902  phage integrase  33.85 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6823  integrase family protein  35.5 
 
 		 358 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3428  phage integrase protein  32.67 
 
 		 440 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1310  hypothetical protein  27.39 
 
 		 438 aa  143  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  24.27 
 
 		 458 aa  90.5  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  25.37 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  26.68 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  26.21 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0788  Phage integrase  25.36 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  27.44 
 
 		 605 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3509  putative phage integrase family protein  29.22 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3553  phage integrase  23.15 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.631113  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  23.6 
 
 		 581 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  22.37 
 
 		 386 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  27.55 
 
 		 568 aa  53.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  26.01 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  27.27 
 
 		 452 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1842  putative phage integrase family protein  32.26 
 
 		 113 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  21.78 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  29.65 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  23.71 
 
 		 618 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  24.56 
 
 		 649 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  21.22 
 
 		 635 aa  44.3  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  24.56 
 
 		 556 aa  44.3  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1378  site-specific recombinase XerD-like  22.78 
 
 		 400 aa  43.5  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.106442  normal  0.166813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  27.45 
 
 		 564 aa  43.5  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  23.53 
 
 		 401 aa  43.1  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  23.18 
 
 		 563 aa  43.1  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  27.09 
 
 		 567 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>