101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4535 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  100 
 
 		 473 aa  971    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  50 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0788  Phage integrase  42.95 
 
 		 459 aa  341  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  38.03 
 
 		 490 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3553  phage integrase  30.39 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.631113  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  29.86 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6823  integrase family protein  30.53 
 
 		 358 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1310  hypothetical protein  26.02 
 
 		 438 aa  97.8  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2329  phage integrase family protein  25.64 
 
 		 454 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0957732  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3521  phage integrase  27.68 
 
 		 422 aa  92.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1997  phage integrase  26.8 
 
 		 422 aa  90.5  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.559264  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  27.8 
 
 		 566 aa  90.5  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3428  phage integrase protein  28.57 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3313  phage integrase family protein  26.02 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1902  phage integrase  29.47 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183596  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0192  integrase family protein  25.71 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  26.99 
 
 		 588 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  24.77 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  29.18 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  26.25 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  25 
 
 		 436 aa  67  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  24.22 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  24.37 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  24.66 
 
 		 529 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  24.73 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  24.91 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  27.9 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  24.84 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  21.65 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  26.24 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  20.92 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  24.49 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  25.74 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1378  site-specific recombinase XerD-like  25.06 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.106442  normal  0.166813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  25.21 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  21.36 
 
 		 564 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  22.29 
 
 		 687 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  22.26 
 
 		 529 aa  57  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 499 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 568 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  25.83 
 
 		 550 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  19.72 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  24.92 
 
 		 538 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  21.45 
 
 		 456 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  25.38 
 
 		 297 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  26.14 
 
 		 304 aa  55.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  27.83 
 
 		 334 aa  54.7  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  24.44 
 
 		 386 aa  53.9  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  26.63 
 
 		 337 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  26.63 
 
 		 331 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  26.63 
 
 		 331 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  28.9 
 
 		 588 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.27 
 
 		 294 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  28.29 
 
 		 535 aa  51.6  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  23.43 
 
 		 479 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  24.07 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  26.64 
 
 		 498 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0730  hypothetical protein  31.36 
 
 		 455 aa  50.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  25.76 
 
 		 307 aa  49.3  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  32.47 
 
 		 567 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  23.45 
 
 		 304 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  26.52 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  24.56 
 
 		 509 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2312  hypothetical protein  24.03 
 
 		 364 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  25.47 
 
 		 295 aa  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  27.92 
 
 		 527 aa  48.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  24.63 
 
 		 560 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  27.09 
 
 		 329 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0292  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 354 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  25.65 
 
 		 388 aa  47.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  22.93 
 
 		 291 aa  47.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  24.11 
 
 		 663 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3424  integrase family protein  34.74 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  26.56 
 
 		 317 aa  47  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0978  site-specific tyrosine recombinase XerS  22.74 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  22.97 
 
 		 651 aa  46.6  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0777  integrase family protein  31.13 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000241017 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0597  integrase family protein  25.58 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  28.68 
 
 		 304 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  31.41 
 
 		 311 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  28.57 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1170  integrase family protein  24.09 
 
 		 368 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.429636 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  22.47 
 
 		 341 aa  45.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  25.82 
 
 		 370 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  25.26 
 
 		 582 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  24.31 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  25.08 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  27.1 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  26.51 
 
 		 302 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.64 
 
 		 300 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.64 
 
 		 300 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.64 
 
 		 300 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  27.88 
 
 		 392 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1229  hypothetical protein  27.17 
 
 		 406 aa  43.9  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505856  normal  0.279847 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  24.02 
 
 		 491 aa  43.5  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  24.81 
 
 		 311 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  29.41 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  23.05 
 
 		 295 aa  43.5  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  24.82 
 
 		 370 aa  43.5  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>