30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1997 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1997  phage integrase  100 
 
 
422 aa  860    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.559264  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3521  phage integrase  88.63 
 
 
422 aa  743    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1902  phage integrase  63.74 
 
 
422 aa  552  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183596  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3313  phage integrase family protein  53.74 
 
 
430 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2329  phage integrase family protein  37.97 
 
 
454 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0957732  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6823  integrase family protein  39.88 
 
 
358 aa  255  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0192  integrase family protein  35.54 
 
 
461 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108985  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3428  phage integrase protein  34.99 
 
 
440 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3509  putative phage integrase family protein  48.78 
 
 
190 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1310  hypothetical protein  29.3 
 
 
438 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1842  putative phage integrase family protein  45.87 
 
 
113 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  28.94 
 
 
473 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  25.45 
 
 
458 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  29.96 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  30.2 
 
 
490 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  24.29 
 
 
566 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  27.61 
 
 
386 aa  57.8  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  27.62 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  25.63 
 
 
635 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  30.64 
 
 
649 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  30.64 
 
 
556 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  27.41 
 
 
568 aa  50.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0788  Phage integrase  23.39 
 
 
459 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7622  integrase family protein  24.71 
 
 
405 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.530017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  26.44 
 
 
479 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  23.64 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  26.67 
 
 
317 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6953  integrase family protein  28.74 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  23.9 
 
 
430 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  22.22 
 
 
426 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.466932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>