36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2329 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2329  phage integrase family protein  100 
 
 
454 aa  931    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0957732  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0192  integrase family protein  51.29 
 
 
461 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108985  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1997  phage integrase  37.97 
 
 
422 aa  265  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.559264  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3521  phage integrase  39 
 
 
422 aa  264  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1902  phage integrase  35.23 
 
 
422 aa  236  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183596  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3313  phage integrase family protein  35.09 
 
 
430 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6823  integrase family protein  34.97 
 
 
358 aa  194  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3428  phage integrase protein  31.82 
 
 
440 aa  190  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1310  hypothetical protein  30.53 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  26.14 
 
 
458 aa  93.2  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  28.31 
 
 
473 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  24.95 
 
 
490 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0788  Phage integrase  25.16 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  29.79 
 
 
414 aa  64.3  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  27.98 
 
 
605 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  29.82 
 
 
386 aa  57  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  31.18 
 
 
568 aa  57  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  25.63 
 
 
401 aa  55.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  22.93 
 
 
434 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  21.46 
 
 
386 aa  51.6  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  27.68 
 
 
412 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3553  phage integrase  22.22 
 
 
392 aa  50.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.631113  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  27.68 
 
 
452 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  26.53 
 
 
529 aa  50.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  23.43 
 
 
499 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  23.92 
 
 
566 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  30.22 
 
 
563 aa  47  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  26.24 
 
 
564 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  26.55 
 
 
430 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  26.45 
 
 
581 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  28 
 
 
509 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  25.32 
 
 
441 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  30 
 
 
527 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3509  putative phage integrase family protein  24.14 
 
 
190 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  26.03 
 
 
441 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  26.9 
 
 
498 aa  43.1  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>