32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0788 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0788  Phage integrase  100 
 
 		 459 aa  939    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  42.95 
 
 		 473 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  41.48 
 
 		 458 aa  329  7e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  36.88 
 
 		 490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3553  phage integrase  31.83 
 
 		 392 aa  157  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.631113  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  30.95 
 
 		 414 aa  106  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3428  phage integrase protein  25.05 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1310  hypothetical protein  26.91 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2329  phage integrase family protein  25.16 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0957732  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0192  integrase family protein  25.36 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6823  integrase family protein  26.91 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1902  phage integrase  26.88 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183596  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3313  phage integrase family protein  29.35 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  25.26 
 
 		 566 aa  63.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  28.33 
 
 		 566 aa  63.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  24.34 
 
 		 426 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  24.73 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  25 
 
 		 515 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  31.93 
 
 		 588 aa  53.5  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  28.31 
 
 		 538 aa  52.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  27.51 
 
 		 479 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  29.44 
 
 		 687 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3521  phage integrase  24.28 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222857 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  23.77 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  26.38 
 
 		 550 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1997  phage integrase  23.39 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.559264  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  23.22 
 
 		 456 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  22.09 
 
 		 588 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  21.39 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  24 
 
 		 332 aa  44.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  27.53 
 
 		 568 aa  43.9  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  27.81 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>