26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1310 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1310  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  907    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3428  phage integrase protein  30.66 
 
 
440 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1997  phage integrase  29.3 
 
 
422 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.559264  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1902  phage integrase  27.88 
 
 
422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6823  integrase family protein  31.62 
 
 
358 aa  146  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2329  phage integrase family protein  30.53 
 
 
454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0957732  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0192  integrase family protein  27.17 
 
 
461 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108985  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3313  phage integrase family protein  27.13 
 
 
430 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3521  phage integrase  34.2 
 
 
422 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  28.06 
 
 
458 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  26.02 
 
 
473 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  26.59 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  29.48 
 
 
490 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0788  Phage integrase  26.91 
 
 
459 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3553  phage integrase  26.07 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.631113  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  35.71 
 
 
566 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  34.68 
 
 
386 aa  49.7  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  23.58 
 
 
479 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  28.25 
 
 
564 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  24.06 
 
 
588 aa  47  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  27.97 
 
 
550 aa  47  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  26.44 
 
 
568 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1170  integrase family protein  20.36 
 
 
368 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.429636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  24.66 
 
 
657 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1378  site-specific recombinase XerD-like  26.14 
 
 
400 aa  43.9  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.106442  normal  0.166813 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  26.02 
 
 
434 aa  43.5  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>