161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0868 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  73.35 
 
 		 535 aa  727    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  100 
 
 		 498 aa  1031    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  31.17 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  27.27 
 
 		 434 aa  126  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  30.42 
 
 		 529 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  28.12 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  34.5 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  26.42 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  29.04 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  28.38 
 
 		 566 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  31.2 
 
 		 509 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  27.7 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  25.6 
 
 		 588 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  26.89 
 
 		 662 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  28.52 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  28.38 
 
 		 556 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  28.38 
 
 		 649 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  26.61 
 
 		 589 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  26.67 
 
 		 651 aa  90.5  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  26.69 
 
 		 646 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  29.23 
 
 		 538 aa  86.7  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  25.95 
 
 		 550 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  30.17 
 
 		 566 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  24.38 
 
 		 564 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  29.63 
 
 		 515 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0730  hypothetical protein  26.74 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  27.82 
 
 		 605 aa  77  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  24.47 
 
 		 618 aa  77  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  31.87 
 
 		 651 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  24.8 
 
 		 581 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  30.66 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  24.57 
 
 		 563 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  23.68 
 
 		 687 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  25.93 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  23.77 
 
 		 602 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  24.54 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  29.48 
 
 		 540 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  28.24 
 
 		 564 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  23.89 
 
 		 593 aa  68.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  24.83 
 
 		 548 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  25.69 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  25.42 
 
 		 529 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4174  integrase family protein  24.48 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  25.93 
 
 		 616 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0001  integrase  25 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  28.29 
 
 		 567 aa  61.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  25.81 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  25.74 
 
 		 529 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  26.52 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  25.12 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  26.1 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1429  integrase family protein  25 
 
 		 578 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  26.48 
 
 		 565 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  26.48 
 
 		 533 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  27.52 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  25.11 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  25 
 
 		 560 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  22.95 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  27.31 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  24.43 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  25.99 
 
 		 358 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002228  putative integrase  24.23 
 
 		 431 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  23.61 
 
 		 456 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  26.87 
 
 		 657 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  24 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  26.21 
 
 		 425 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  25.97 
 
 		 602 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3356  phage integrase family protein  23.34 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  27.39 
 
 		 310 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  27.12 
 
 		 482 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  22.98 
 
 		 527 aa  54.3  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  29.89 
 
 		 720 aa  54.3  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  25.37 
 
 		 619 aa  53.5  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.49 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  24.45 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 687 aa  52  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.32 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  24.48 
 
 		 293 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  24.71 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  23.03 
 
 		 559 aa  51.2  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  26.64 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  25 
 
 		 405 aa  50.8  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  22.54 
 
 		 568 aa  50.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  23.04 
 
 		 302 aa  50.8  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  24.89 
 
 		 395 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 407 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  26.75 
 
 		 441 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  25.49 
 
 		 340 aa  50.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  25.48 
 
 		 308 aa  50.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  25.45 
 
 		 402 aa  50.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4785  integrase family protein  27.08 
 
 		 284 aa  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000301446  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  25.28 
 
 		 300 aa  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  23.66 
 
 		 538 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  28.06 
 
 		 305 aa  49.7  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  30.48 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5437  integrase family protein  25.71 
 
 		 471 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  23.31 
 
 		 297 aa  49.7  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.31 
 
 		 297 aa  49.7  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>