134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2361 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  100 
 
 		 605 aa  1239    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  41.38 
 
 		 563 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  40.83 
 
 		 581 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  28.01 
 
 		 588 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  29.65 
 
 		 509 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  28.64 
 
 		 566 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  26.58 
 
 		 602 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  32.44 
 
 		 687 aa  156  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  31.59 
 
 		 568 aa  155  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  26.27 
 
 		 589 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  27.69 
 
 		 564 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  28.16 
 
 		 529 aa  140  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  29.06 
 
 		 550 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 593 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  26.22 
 
 		 566 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  30 
 
 		 499 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  29.58 
 
 		 441 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  25.74 
 
 		 635 aa  127  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  29.68 
 
 		 386 aa  126  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  23.77 
 
 		 616 aa  125  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  28.45 
 
 		 388 aa  124  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  27.82 
 
 		 556 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  27.55 
 
 		 565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  30.21 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  27.82 
 
 		 649 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  28.08 
 
 		 434 aa  120  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  30.49 
 
 		 441 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  27.03 
 
 		 540 aa  118  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  31.41 
 
 		 538 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  27.57 
 
 		 430 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  26.8 
 
 		 548 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  31.48 
 
 		 401 aa  110  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  27.51 
 
 		 618 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  31.84 
 
 		 426 aa  109  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  24.16 
 
 		 515 aa  107  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  26.69 
 
 		 646 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  29.1 
 
 		 602 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  23.26 
 
 		 386 aa  104  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  27.14 
 
 		 662 aa  102  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  25.91 
 
 		 381 aa  100  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  24.64 
 
 		 472 aa  98.6  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  29.12 
 
 		 533 aa  98.2  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  29.04 
 
 		 348 aa  97.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  26.72 
 
 		 430 aa  97.1  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  27.71 
 
 		 588 aa  93.6  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  24.51 
 
 		 582 aa  93.6  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  24.01 
 
 		 564 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  29.71 
 
 		 358 aa  91.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  24.68 
 
 		 559 aa  91.3  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  31.23 
 
 		 509 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  25.67 
 
 		 535 aa  90.5  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  33.52 
 
 		 602 aa  87.4  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  22.48 
 
 		 651 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  27.64 
 
 		 657 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  28.21 
 
 		 651 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  24.3 
 
 		 531 aa  82.8  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  27.76 
 
 		 720 aa  82.8  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  28.35 
 
 		 619 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  29.25 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  29.25 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  25.58 
 
 		 560 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  27.82 
 
 		 498 aa  77  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  28.99 
 
 		 692 aa  76.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  22.76 
 
 		 599 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  29.17 
 
 		 567 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  27.17 
 
 		 529 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  27.71 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  29.33 
 
 		 538 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  26.91 
 
 		 587 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3658  phage integrase  25 
 
 		 470 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  25.32 
 
 		 456 aa  67  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  23.34 
 
 		 479 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  28.32 
 
 		 508 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  28.32 
 
 		 508 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  25.82 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  26.77 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  27.89 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  26.62 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  25.4 
 
 		 692 aa  61.6  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  29.28 
 
 		 549 aa  61.2  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  25.78 
 
 		 687 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0192  integrase family protein  31.4 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  26.17 
 
 		 527 aa  58.2  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2329  phage integrase family protein  27.98 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0957732  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  29.52 
 
 		 563 aa  57  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  26.74 
 
 		 361 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  28.98 
 
 		 310 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  27.33 
 
 		 331 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  27.33 
 
 		 331 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  27.33 
 
 		 337 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2770  integrase family protein  24.55 
 
 		 434 aa  53.9  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00484712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1429  integrase family protein  26.44 
 
 		 578 aa  53.9  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  27.09 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3313  phage integrase family protein  29.76 
 
 		 430 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  26.07 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2524.1  hypothetical protein  44.26 
 
 		 308 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.547452  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  22.66 
 
 		 584 aa  52  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1229  hypothetical protein  28 
 
 		 406 aa  52  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505856  normal  0.279847 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  28.79 
 
 		 431 aa  52  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>