81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1505 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  100 
 
 
582 aa  1194    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  30.85 
 
 
566 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  26.28 
 
 
602 aa  117  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  26.71 
 
 
564 aa  115  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  24.95 
 
 
563 aa  114  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  28.67 
 
 
566 aa  104  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  32.69 
 
 
401 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  27.38 
 
 
588 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  26.33 
 
 
550 aa  97.4  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  26.18 
 
 
509 aa  97.1  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  27.05 
 
 
538 aa  97.1  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  27.08 
 
 
548 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  24.01 
 
 
605 aa  92  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  27.27 
 
 
436 aa  91.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  28.62 
 
 
687 aa  91.3  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  25.8 
 
 
646 aa  90.5  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  25.38 
 
 
651 aa  89.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  30.23 
 
 
533 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  25.71 
 
 
602 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  27.49 
 
 
588 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  29.93 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  27.03 
 
 
593 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  23.71 
 
 
581 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  23.48 
 
 
565 aa  81.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  25.21 
 
 
635 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  25 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  23.6 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  27.27 
 
 
616 aa  73.9  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  27.2 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  25.39 
 
 
472 aa  72  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  25.58 
 
 
568 aa  71.6  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  26.72 
 
 
439 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  25.59 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  24.31 
 
 
434 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  29.67 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  26.84 
 
 
564 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  24.5 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  25.35 
 
 
657 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  25.34 
 
 
720 aa  67.8  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  24.91 
 
 
618 aa  67  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  32.37 
 
 
649 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  32.37 
 
 
556 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  28.17 
 
 
529 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  25.86 
 
 
529 aa  65.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  28.46 
 
 
412 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  28.46 
 
 
452 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  22.83 
 
 
559 aa  63.9  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  24.89 
 
 
549 aa  63.9  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  25.87 
 
 
589 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  25.49 
 
 
662 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  26.7 
 
 
499 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  29.85 
 
 
692 aa  61.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  27.27 
 
 
540 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  27.54 
 
 
515 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  26.38 
 
 
430 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  26.19 
 
 
426 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  28.17 
 
 
529 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  26.06 
 
 
424 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  28.87 
 
 
509 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  29.71 
 
 
692 aa  54.7  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  31.71 
 
 
602 aa  55.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  27.98 
 
 
358 aa  55.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  22.13 
 
 
430 aa  54.3  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  27.92 
 
 
348 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  27.86 
 
 
405 aa  53.5  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  26.98 
 
 
619 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  26.05 
 
 
599 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  27.78 
 
 
584 aa  52  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  24.75 
 
 
560 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  23.67 
 
 
687 aa  50.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  22.76 
 
 
414 aa  49.7  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  26.44 
 
 
404 aa  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  25.81 
 
 
567 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3313  phage integrase family protein  27.27 
 
 
430 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  30.6 
 
 
563 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  22.66 
 
 
458 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  22.8 
 
 
414 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  26.25 
 
 
403 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  25.26 
 
 
473 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  22.35 
 
 
423 aa  44.3  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  25 
 
 
432 aa  43.9  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>