92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2468 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  100 
 
 		 651 aa  1333    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  32.47 
 
 		 646 aa  318  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  32.28 
 
 		 649 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  44.13 
 
 		 662 aa  290  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  31.03 
 
 		 556 aa  242  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  30.5 
 
 		 436 aa  146  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  28.57 
 
 		 430 aa  140  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  27.81 
 
 		 434 aa  135  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  29.7 
 
 		 529 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  29 
 
 		 566 aa  124  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  30.89 
 
 		 388 aa  124  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  27.58 
 
 		 602 aa  124  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  25.78 
 
 		 566 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  28.12 
 
 		 563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  26.21 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  31.45 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  30 
 
 		 401 aa  112  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  23.87 
 
 		 538 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  29.33 
 
 		 589 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  30.95 
 
 		 540 aa  109  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  29.53 
 
 		 509 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  26.85 
 
 		 616 aa  107  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  28.95 
 
 		 564 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  30.58 
 
 		 588 aa  106  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  29.52 
 
 		 565 aa  105  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  28.2 
 
 		 593 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  29.6 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  34.25 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 582 aa  102  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  24.43 
 
 		 535 aa  101  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  30.61 
 
 		 588 aa  99  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  32.72 
 
 		 581 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  27.78 
 
 		 605 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  27.32 
 
 		 618 aa  95.5  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  24.38 
 
 		 657 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  35.06 
 
 		 533 aa  95.5  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  27.15 
 
 		 412 aa  95.1  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  35.03 
 
 		 472 aa  94.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  27.15 
 
 		 452 aa  94  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  29.58 
 
 		 550 aa  92.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  24.58 
 
 		 687 aa  92.4  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  33.05 
 
 		 559 aa  92  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  32.29 
 
 		 456 aa  92.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 720 aa  90.5  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  29.08 
 
 		 568 aa  90.5  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  31.75 
 
 		 564 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  30.73 
 
 		 439 aa  87.4  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  31.09 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  23.91 
 
 		 498 aa  86.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  29.1 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  25.8 
 
 		 651 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  32.7 
 
 		 548 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  30.71 
 
 		 602 aa  84.3  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  26.43 
 
 		 602 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  22.97 
 
 		 635 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  24.04 
 
 		 549 aa  75.1  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  23.64 
 
 		 560 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  29.48 
 
 		 404 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  29.95 
 
 		 619 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  27.35 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  23.05 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  25 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  35.37 
 
 		 687 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  26.88 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  33.13 
 
 		 587 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  31.03 
 
 		 515 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  24.79 
 
 		 692 aa  63.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  23.77 
 
 		 692 aa  61.6  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  29.94 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  26.86 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  29.95 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  30.43 
 
 		 348 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1223  phage integrase family protein  22.84 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  27.05 
 
 		 567 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0730  hypothetical protein  31.08 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  27.16 
 
 		 538 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  24.93 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  27.61 
 
 		 529 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  28.33 
 
 		 599 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  25.74 
 
 		 424 aa  51.2  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  28.82 
 
 		 310 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  26.53 
 
 		 527 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  25.48 
 
 		 558 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  25.56 
 
 		 508 aa  47.4  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  25.56 
 
 		 508 aa  47.4  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  26.83 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  26.94 
 
 		 294 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  22.73 
 
 		 331 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  22.73 
 
 		 331 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  22.73 
 
 		 337 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3658  phage integrase  28.12 
 
 		 470 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  25.69 
 
 		 473 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>