87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2460 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  100 
 
 		 593 aa  1207    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  29.16 
 
 		 588 aa  188  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  30.65 
 
 		 509 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  27.13 
 
 		 605 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  28.29 
 
 		 568 aa  126  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  25.66 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  26.09 
 
 		 581 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  25.78 
 
 		 563 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  30.13 
 
 		 618 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  29.73 
 
 		 550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  25.73 
 
 		 602 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  27.54 
 
 		 386 aa  107  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  30.08 
 
 		 348 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  36.4 
 
 		 401 aa  106  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  30.64 
 
 		 566 aa  103  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  29.82 
 
 		 588 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  24.73 
 
 		 616 aa  101  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  24.93 
 
 		 646 aa  100  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  29.58 
 
 		 556 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  22.9 
 
 		 564 aa  97.4  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  29.23 
 
 		 649 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  24.84 
 
 		 529 aa  94  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  28.53 
 
 		 434 aa  93.6  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  26.04 
 
 		 430 aa  92.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  30.88 
 
 		 548 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  27.82 
 
 		 651 aa  90.9  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  25.94 
 
 		 651 aa  90.5  7e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  26.58 
 
 		 441 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  26.21 
 
 		 662 aa  89.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  27.3 
 
 		 687 aa  89.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  27.73 
 
 		 388 aa  87.8  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  26.61 
 
 		 381 aa  88.2  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  21.82 
 
 		 566 aa  88.2  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  25.9 
 
 		 635 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  24.1 
 
 		 436 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  27.03 
 
 		 582 aa  83.6  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  29.18 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  28.57 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  25.34 
 
 		 565 aa  81.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  30.8 
 
 		 538 aa  80.5  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  27.17 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  28.33 
 
 		 602 aa  74.7  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  28.47 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  26.98 
 
 		 386 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  25.93 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  23.89 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  29.22 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  21.47 
 
 		 657 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  23.1 
 
 		 559 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  29.52 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  32.54 
 
 		 619 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  22.76 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  29.38 
 
 		 472 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  30.63 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  25.89 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  23 
 
 		 535 aa  60.8  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  28 
 
 		 404 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  29.69 
 
 		 587 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  24.32 
 
 		 508 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  27.19 
 
 		 567 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  30.67 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  24.32 
 
 		 508 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  26.69 
 
 		 692 aa  59.7  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  30.67 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  29.59 
 
 		 560 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  27.91 
 
 		 509 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  22.06 
 
 		 720 aa  55.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  26.88 
 
 		 529 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  22.7 
 
 		 564 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  28.22 
 
 		 441 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2395  integrase family protein  26.32 
 
 		 456 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  25.42 
 
 		 584 aa  53.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  24.37 
 
 		 602 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  27.22 
 
 		 529 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  23.62 
 
 		 692 aa  51.2  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  28.22 
 
 		 599 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  24.2 
 
 		 538 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  24.84 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  28.51 
 
 		 527 aa  47.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  22.09 
 
 		 687 aa  47.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  22.85 
 
 		 450 aa  47  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5437  integrase family protein  24.9 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4174  integrase family protein  32.26 
 
 		 480 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4097  integrase family protein  24.48 
 
 		 464 aa  46.2  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  27.5 
 
 		 424 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  26.92 
 
 		 549 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 558 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>