132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1447 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  100 
 
 		 430 aa  897    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  39.91 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  41.45 
 
 		 434 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  36.29 
 
 		 381 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  31.83 
 
 		 441 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  30.61 
 
 		 588 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  31.67 
 
 		 646 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  27.41 
 
 		 602 aa  156  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  31.85 
 
 		 388 aa  149  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  25.28 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  30.15 
 
 		 556 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  30.15 
 
 		 649 aa  146  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  27.23 
 
 		 509 aa  147  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  31.43 
 
 		 566 aa  142  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  30.22 
 
 		 550 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  26.82 
 
 		 616 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  27.13 
 
 		 529 aa  137  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  26.63 
 
 		 563 aa  136  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  25.14 
 
 		 662 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  26.72 
 
 		 651 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  26.63 
 
 		 687 aa  131  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  28.57 
 
 		 651 aa  126  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  29.17 
 
 		 581 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  26.45 
 
 		 535 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  41.78 
 
 		 538 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  26.42 
 
 		 498 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  28.9 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  26.27 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  27.57 
 
 		 605 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  26.42 
 
 		 566 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  27.84 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  30.57 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  30.57 
 
 		 452 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  26.45 
 
 		 564 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  26.13 
 
 		 564 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  23.14 
 
 		 618 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  25.73 
 
 		 456 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  29.86 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  27.17 
 
 		 540 aa  103  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  26.63 
 
 		 559 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  25.67 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  26.12 
 
 		 568 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  28.25 
 
 		 565 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  28.22 
 
 		 533 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  24.92 
 
 		 439 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  29.05 
 
 		 386 aa  99.8  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  34.44 
 
 		 588 aa  97.1  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 499 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  26.04 
 
 		 593 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  33.9 
 
 		 358 aa  92  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  23.48 
 
 		 589 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  27.6 
 
 		 560 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  26.91 
 
 		 531 aa  86.7  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  32.37 
 
 		 602 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  26.13 
 
 		 529 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  23.38 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  29.65 
 
 		 657 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  28.35 
 
 		 529 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  25.7 
 
 		 515 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  21.36 
 
 		 479 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  28.97 
 
 		 567 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  25.86 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  23.32 
 
 		 548 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  28.95 
 
 		 692 aa  74.7  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1429  integrase family protein  22.33 
 
 		 578 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  26.13 
 
 		 602 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  22.19 
 
 		 720 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  24.76 
 
 		 508 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  24.76 
 
 		 508 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  21.07 
 
 		 635 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  25.29 
 
 		 587 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3029  hypothetical protein  33.09 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.355709  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  26.34 
 
 		 619 aa  67.4  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  24.9 
 
 		 538 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  22.77 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  24.89 
 
 		 692 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002228  putative integrase  28.12 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5437  integrase family protein  25.18 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4097  integrase family protein  27.86 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  28.29 
 
 		 584 aa  57  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  32.04 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  26.34 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  32.04 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  32.04 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  22.75 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 687 aa  55.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2395  integrase family protein  29.81 
 
 		 456 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  24.38 
 
 		 558 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  22.13 
 
 		 582 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0730  hypothetical protein  24.89 
 
 		 455 aa  53.9  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  37.66 
 
 		 549 aa  53.9  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  27.91 
 
 		 348 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  24.58 
 
 		 527 aa  53.5  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4174  integrase family protein  27.09 
 
 		 480 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  23.76 
 
 		 458 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3682  hypothetical protein  23.45 
 
 		 486 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  27.22 
 
 		 450 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  22.15 
 
 		 599 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2498  Phage integrase  29.14 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  24.07 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>