64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0882 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  100 
 
 		 692 aa  1424    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  25.7 
 
 		 616 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  20.21 
 
 		 568 aa  80.5  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  28.8 
 
 		 602 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  30.89 
 
 		 556 aa  77  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  30.89 
 
 		 649 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  20.67 
 
 		 646 aa  77  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  24.14 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  26.49 
 
 		 529 aa  73.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  21.53 
 
 		 581 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  22.12 
 
 		 588 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  24.15 
 
 		 687 aa  69.7  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  27 
 
 		 509 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  24.89 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  20.51 
 
 		 635 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  23.33 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  26.67 
 
 		 560 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  25.93 
 
 		 566 aa  63.9  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  24.74 
 
 		 565 aa  63.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  25.4 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  21.1 
 
 		 563 aa  62  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  24.1 
 
 		 651 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  29.85 
 
 		 582 aa  61.2  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  25.4 
 
 		 605 aa  61.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  24.32 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  22.89 
 
 		 386 aa  60.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  25.89 
 
 		 548 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 593 aa  59.7  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  24.17 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  24.17 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  26.49 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  19.87 
 
 		 550 aa  58.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  23.48 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  21.52 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  21.52 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  23.18 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  26.07 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  23.05 
 
 		 589 aa  57  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  23.65 
 
 		 401 aa  57.4  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  24.63 
 
 		 430 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  25.24 
 
 		 441 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  25.36 
 
 		 439 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  31.78 
 
 		 602 aa  55.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  25.9 
 
 		 499 aa  54.3  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 538 aa  52.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  25.51 
 
 		 619 aa  52.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  24.78 
 
 		 662 aa  52  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  25.81 
 
 		 509 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  24.64 
 
 		 426 aa  51.6  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  25.24 
 
 		 456 aa  51.2  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  23.98 
 
 		 588 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  27.59 
 
 		 533 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  22.57 
 
 		 564 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  24.87 
 
 		 587 aa  48.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  24.38 
 
 		 651 aa  47  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  23.15 
 
 		 527 aa  47  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  23.68 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  31 
 
 		 563 aa  47.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3682  hypothetical protein  25.74 
 
 		 486 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  29.1 
 
 		 358 aa  46.2  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  24.83 
 
 		 564 aa  45.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  26.55 
 
 		 424 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  46.67 
 
 		 531 aa  43.9  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  25.44 
 
 		 559 aa  43.9  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>