122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1799 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  100 
 
 		 531 aa  1097    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  26.24 
 
 		 602 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  28.37 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  23.78 
 
 		 616 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  26.51 
 
 		 436 aa  95.1  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  25.83 
 
 		 588 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  26.91 
 
 		 430 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  22.77 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  24.67 
 
 		 509 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  27.74 
 
 		 550 aa  84.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  25.58 
 
 		 559 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  23.34 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  24.3 
 
 		 605 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 499 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  27.09 
 
 		 565 aa  79  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  32.77 
 
 		 581 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  24.04 
 
 		 538 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  25 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  27.76 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  25.55 
 
 		 651 aa  74.7  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  27.12 
 
 		 687 aa  73.9  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  24.93 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  27.08 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  24.71 
 
 		 568 aa  69.7  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  33.13 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  22.63 
 
 		 563 aa  67.8  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  27.1 
 
 		 560 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  25.97 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  22.14 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  25.47 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2498  Phage integrase  27.53 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  26.09 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.02 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  22.31 
 
 		 646 aa  60.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  25.32 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  24.25 
 
 		 618 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  27.53 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3658  phage integrase  27.14 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  27.68 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  25 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  24.02 
 
 		 564 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  25.87 
 
 		 692 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002228  putative integrase  25.18 
 
 		 431 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  25.28 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  24.4 
 
 		 649 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  27.65 
 
 		 369 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  24.07 
 
 		 365 aa  55.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.82 
 
 		 313 aa  55.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  24.4 
 
 		 556 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5437  integrase family protein  23.1 
 
 		 471 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1223  phage integrase family protein  23.68 
 
 		 402 aa  53.9  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.65 
 
 		 369 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  23.4 
 
 		 386 aa  53.5  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.88 
 
 		 400 aa  53.5  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  27.95 
 
 		 308 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4097  integrase family protein  24.63 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  26.45 
 
 		 394 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  26.3 
 
 		 540 aa  52  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  25.58 
 
 		 602 aa  52  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  22.09 
 
 		 548 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  22.06 
 
 		 662 aa  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1429  integrase family protein  22.43 
 
 		 578 aa  50.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  26.23 
 
 		 383 aa  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  24.92 
 
 		 509 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  28.02 
 
 		 309 aa  48.9  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  23.94 
 
 		 584 aa  49.3  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  23.79 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  27.81 
 
 		 433 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  24.93 
 
 		 651 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  23.55 
 
 		 324 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  29.91 
 
 		 567 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  23.49 
 
 		 587 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  33.33 
 
 		 369 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  28.66 
 
 		 378 aa  47.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  25.7 
 
 		 307 aa  47.8  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  23.88 
 
 		 635 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  26.8 
 
 		 348 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.92 
 
 		 391 aa  47.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  27.42 
 
 		 588 aa  47.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  22.62 
 
 		 376 aa  47.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  26.59 
 
 		 320 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  29.84 
 
 		 589 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.54 
 
 		 299 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.86 
 
 		 311 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  23.68 
 
 		 535 aa  46.6  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.9 
 
 		 323 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.59 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.54 
 
 		 299 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3933  integrase family protein  24.29 
 
 		 344 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00343242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.54 
 
 		 299 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.36 
 
 		 300 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  28.67 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  23.15 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.12 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  24.18 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0082  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.71 
 
 		 339 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  26.18 
 
 		 352 aa  45.1  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  30.23 
 
 		 529 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  19.51 
 
 		 439 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  25.97 
 
 		 287 aa  45.1  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>