65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1653 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  100 
 
 		 482 aa  982    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  23.34 
 
 		 531 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  25.78 
 
 		 687 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  26.51 
 
 		 564 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  34.81 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  24 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  28.7 
 
 		 538 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  32.81 
 
 		 529 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  24.4 
 
 		 566 aa  71.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  28.7 
 
 		 568 aa  70.9  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  26.47 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  27.2 
 
 		 566 aa  70.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2524.1  hypothetical protein  25.84 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.547452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  28.21 
 
 		 588 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  25.77 
 
 		 605 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  25.9 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  23.08 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  24.61 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  30.77 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  26.09 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  30 
 
 		 581 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  26.03 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  24.85 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  28.32 
 
 		 567 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  24.44 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  26.8 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  28.39 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  34.32 
 
 		 565 aa  57  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  26.76 
 
 		 439 aa  57  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  30.73 
 
 		 386 aa  57  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  31.93 
 
 		 559 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  26.11 
 
 		 616 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  27.12 
 
 		 498 aa  54.3  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  23.75 
 
 		 602 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  30.07 
 
 		 509 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  24.88 
 
 		 533 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  29.48 
 
 		 434 aa  53.9  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  19.59 
 
 		 472 aa  53.5  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  23.46 
 
 		 381 aa  53.5  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  26.44 
 
 		 515 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  22.22 
 
 		 556 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  22.22 
 
 		 649 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  26.86 
 
 		 509 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  27.59 
 
 		 529 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  25.44 
 
 		 563 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  26.91 
 
 		 540 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3553  phage integrase  25.64 
 
 		 392 aa  50.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.631113  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  28.86 
 
 		 383 aa  50.1  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  27.22 
 
 		 599 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  23.91 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  27.03 
 
 		 479 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  28.07 
 
 		 550 aa  47.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  21.69 
 
 		 618 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.51 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1378  site-specific recombinase XerD-like  24.1 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.106442  normal  0.166813 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002228  putative integrase  21.66 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  27.09 
 
 		 602 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  23.05 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3313  phage integrase family protein  26.16 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.94 
 
 		 297 aa  44.7  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  22.94 
 
 		 297 aa  44.7  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  26.87 
 
 		 362 aa  43.9  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  24.19 
 
 		 358 aa  43.9  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  22.78 
 
 		 454 aa  43.9  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.49 
 
 		 414 aa  43.9  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>