100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002228 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002228  putative integrase  100 
 
 		 431 aa  897    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  27.63 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  26.97 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2498  Phage integrase  27.7 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  22.94 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  25.82 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  24.8 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.16 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  25.48 
 
 		 529 aa  62.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.8 
 
 		 299 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.81 
 
 		 299 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.44 
 
 		 299 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.44 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.44 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  28.12 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.81 
 
 		 299 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.44 
 
 		 299 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.44 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  24.08 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  28.07 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1223  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.92 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.35 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4897  integrase family protein  26.47 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  25.18 
 
 		 531 aa  56.6  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  24.23 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  27.49 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.35 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  32.62 
 
 		 362 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  22.88 
 
 		 296 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4097  integrase family protein  27.59 
 
 		 464 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  29.82 
 
 		 434 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  26.95 
 
 		 456 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  33.8 
 
 		 363 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  24.45 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3658  phage integrase  24.68 
 
 		 470 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  27.36 
 
 		 479 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  25.84 
 
 		 588 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  25.57 
 
 		 287 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  25.34 
 
 		 533 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  23.64 
 
 		 651 aa  51.2  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  24.9 
 
 		 564 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 538 aa  50.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  23.98 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  27.24 
 
 		 509 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  22.37 
 
 		 335 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  27.19 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  25.19 
 
 		 292 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  24.51 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  20.47 
 
 		 297 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  29.75 
 
 		 646 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  20.47 
 
 		 297 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  24.7 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4760  integrase family protein  23.77 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4174  integrase family protein  24.85 
 
 		 480 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  27.38 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  22.69 
 
 		 290 aa  47.8  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  32.45 
 
 		 291 aa  47.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  26.75 
 
 		 331 aa  47.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  26.75 
 
 		 331 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2395  integrase family protein  26.5 
 
 		 456 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  24.71 
 
 		 391 aa  46.6  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  24.19 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  26.8 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  29.59 
 
 		 687 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  22.46 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  25.29 
 
 		 649 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  24.19 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  21.43 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  25.29 
 
 		 556 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  21.66 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  25.74 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  21.43 
 
 		 260 aa  45.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1555  tyrosine recombinase XerD  23.53 
 
 		 290 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  26.36 
 
 		 336 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  22.26 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  25.57 
 
 		 540 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4046  hypothetical protein  27.07 
 
 		 189 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  22.98 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1554  integrase family protein  30 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  decreased coverage  0.00111318 
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  29.93 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  26.67 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  26.67 
 
 		 446 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  26.25 
 
 		 563 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  23.74 
 
 		 587 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  27.2 
 
 		 687 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  23.79 
 
 		 356 aa  44.3  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  26.06 
 
 		 310 aa  43.9  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  27.09 
 
 		 282 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  23.89 
 
 		 430 aa  43.9  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  24.86 
 
 		 310 aa  43.9  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  22.89 
 
 		 287 aa  43.5  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  29.2 
 
 		 398 aa  43.5  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  29.2 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  29.2 
 
 		 431 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  25.1 
 
 		 566 aa  43.5  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  19.44 
 
 		 405 aa  43.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.33 
 
 		 414 aa  43.1  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>