46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2395 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4097  integrase family protein  75.38 
 
 
464 aa  650    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2395  integrase family protein  100 
 
 
456 aa  927    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975926  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5437  integrase family protein  54.68 
 
 
471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636069  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4174  integrase family protein  45.16 
 
 
480 aa  350  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3658  phage integrase  38.56 
 
 
470 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  30.64 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2498  Phage integrase  25.33 
 
 
422 aa  99.8  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1223  phage integrase family protein  31.82 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159042  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  34.78 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  27.54 
 
 
529 aa  77  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  30.88 
 
 
550 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  27.51 
 
 
388 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  30.77 
 
 
646 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  27.27 
 
 
602 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  27.76 
 
 
581 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  29.87 
 
 
434 aa  56.6  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  27.87 
 
 
441 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  29.81 
 
 
430 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  26.32 
 
 
593 aa  53.9  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  22.22 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  24.14 
 
 
651 aa  52.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  30.69 
 
 
616 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  27.92 
 
 
436 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  25.45 
 
 
565 aa  50.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  25.16 
 
 
490 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  23.84 
 
 
386 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  23.57 
 
 
430 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  23.72 
 
 
538 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  26.89 
 
 
425 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002228  putative integrase  26.5 
 
 
431 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.61 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  25.99 
 
 
559 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  26.03 
 
 
182 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  26.59 
 
 
295 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  26.98 
 
 
568 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  27.72 
 
 
687 aa  44.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  27.53 
 
 
285 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.52 
 
 
400 aa  44.3  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  27.11 
 
 
292 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  27.11 
 
 
292 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  27.11 
 
 
292 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  23.56 
 
 
291 aa  43.5  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  26.73 
 
 
416 aa  43.5  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  25.66 
 
 
441 aa  43.9  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  21.98 
 
 
302 aa  43.5  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  25.68 
 
 
291 aa  43.1  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>