90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2498 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2498  Phage integrase  100 
 
 		 422 aa  870    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3658  phage integrase  27.51 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  27.8 
 
 		 450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4174  integrase family protein  23.92 
 
 		 480 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2395  integrase family protein  25.33 
 
 		 456 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  26.52 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5437  integrase family protein  23.08 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002228  putative integrase  27.7 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4097  integrase family protein  23.25 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  32.37 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1223  phage integrase family protein  34.35 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  32.89 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  28.18 
 
 		 566 aa  64.3  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  25.43 
 
 		 529 aa  63.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  28.24 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  24.04 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  27.53 
 
 		 531 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  33.81 
 
 		 538 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  28.81 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  28.89 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  26.2 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  27.37 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  29.44 
 
 		 646 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  22.55 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  26.72 
 
 		 439 aa  57  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3933  integrase family protein  21.76 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00343242  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  25.97 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  23.05 
 
 		 344 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  26.95 
 
 		 602 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  29.12 
 
 		 588 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  28.81 
 
 		 386 aa  54.3  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.43 
 
 		 305 aa  53.9  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  27.17 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  25.2 
 
 		 302 aa  53.5  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  23.05 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  24.64 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  23.05 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  27.1 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.03 
 
 		 297 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  22.82 
 
 		 309 aa  50.8  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  29.14 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  28.05 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  24.43 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0865  integrase family protein  23.92 
 
 		 353 aa  50.4  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  26.59 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  27.33 
 
 		 386 aa  50.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  24.37 
 
 		 390 aa  50.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  25.79 
 
 		 581 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  29.45 
 
 		 616 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  23.26 
 
 		 605 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  25.19 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  30 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  25.3 
 
 		 292 aa  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  26.92 
 
 		 649 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  26.92 
 
 		 556 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  28.04 
 
 		 687 aa  47  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  26.44 
 
 		 637 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  28.3 
 
 		 369 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  26.67 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0600  phage integrase family protein  28 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  28.04 
 
 		 535 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  23.69 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.63 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0912  integrase family protein  22.33 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  24.58 
 
 		 499 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  25.4 
 
 		 296 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.48 
 
 		 300 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1973  integrase family protein  24.68 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0126366 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  25.51 
 
 		 305 aa  44.7  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  25.84 
 
 		 560 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1028  Phage integrase  25.62 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214982  normal  0.0128497 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2705  integrase family protein  21.4 
 
 		 304 aa  44.3  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.800791  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  26.7 
 
 		 662 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  25.77 
 
 		 479 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  23.14 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  27.53 
 
 		 515 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  26.34 
 
 		 651 aa  43.9  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  22.56 
 
 		 376 aa  43.9  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  22.83 
 
 		 401 aa  43.9  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4897  integrase family protein  30.95 
 
 		 336 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  26.44 
 
 		 373 aa  43.9  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1378  site-specific recombinase XerD-like  22.93 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.106442  normal  0.166813 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  24.12 
 
 		 498 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  27.5 
 
 		 367 aa  43.5  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  25.21 
 
 		 411 aa  43.5  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0098  integrase family protein  25.64 
 
 		 298 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  21.8 
 
 		 675 aa  43.1  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  24.86 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  26.06 
 
 		 223 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25 
 
 		 383 aa  43.1  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>