More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1118 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  100 
 
 		 384 aa  761    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  43.19 
 
 		 371 aa  259  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1394  integrase family protein  38.58 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0589061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1457  integrase family protein  40.16 
 
 		 380 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3390  phage integrase  40.53 
 
 		 380 aa  242  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1294  integrase family protein  40.45 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  39.74 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1347  phage integrase family protein  35.08 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0795  integrase family protein  34.92 
 
 		 401 aa  179  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5647  integrase family protein  32.34 
 
 		 410 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1401  hypothetical protein  41.52 
 
 		 323 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1569  integrase family protein  33.42 
 
 		 422 aa  142  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  28.9 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1973  integrase family protein  35.9 
 
 		 450 aa  92.8  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0126366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  29.87 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1936  phage integrase family protein  33.93 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0331565  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  30.8 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.23 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  29.25 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  23.68 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.3 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  28.82 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  27.8 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  31.07 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.91 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.33 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.3 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.57 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  27.44 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0749  phage integrase family protein  36.89 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  22.34 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  24.66 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  28.27 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  24.75 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  27.07 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  28.18 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  21.67 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.5 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  23.05 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  32.21 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  24 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.76 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  23.51 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  26.96 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  28.38 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.99 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  28.06 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.97 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.07 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  19.74 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  28.26 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3933  integrase family protein  21.53 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00343242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.61 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  25.3 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.61 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  26.62 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  24.86 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  25.27 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  27.34 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.23 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1679  integrase  23.6 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  22.01 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  30.54 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  22.67 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  27.27 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  26.32 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  27.49 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  21.71 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.69 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  25.85 
 
 		 379 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  25.85 
 
 		 379 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  25.73 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  25.69 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  21.21 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  28.42 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  20.5 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  26.57 
 
 		 287 aa  56.2  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  27.93 
 
 		 422 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  26.67 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  31.45 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  23.91 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  22.88 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  28.21 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  28.51 
 
 		 452 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0498  phage integrase family protein  25.98 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000218969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  22.94 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.86 
 
 		 454 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  25.14 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.05 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  27.24 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  29.59 
 
 		 172 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  19.95 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  26.9 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  29.07 
 
 		 376 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.62 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  32.93 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  21.04 
 
 		 368 aa  53.5  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>