23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1401 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1401  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1457  integrase family protein  54.13 
 
 
380 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  52.75 
 
 
371 aa  226  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1394  integrase family protein  51.61 
 
 
396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0589061  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3390  phage integrase  50 
 
 
380 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  50 
 
 
397 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1294  integrase family protein  43.69 
 
 
393 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1347  phage integrase family protein  42.79 
 
 
374 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  41.52 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5647  integrase family protein  34.84 
 
 
410 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0795  integrase family protein  35.35 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1569  integrase family protein  34.16 
 
 
422 aa  82  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  31.62 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  24.86 
 
 
387 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  21.29 
 
 
386 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  23.35 
 
 
413 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  23.08 
 
 
400 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  30.13 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.17 
 
 
378 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  26.36 
 
 
408 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  24.7 
 
 
414 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3873  integrase family protein  30.1 
 
 
439 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00124247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  27.43 
 
 
418 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>