More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0768 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  100 
 
 		 397 aa  793    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  58.95 
 
 		 371 aa  423  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1457  integrase family protein  53.37 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3390  phage integrase  50.39 
 
 		 380 aa  349  5e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1394  integrase family protein  42.42 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0589061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1294  integrase family protein  46.43 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  39.74 
 
 		 384 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1401  hypothetical protein  50 
 
 		 323 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1347  phage integrase family protein  38.4 
 
 		 374 aa  199  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5647  integrase family protein  36.19 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0795  integrase family protein  33.08 
 
 		 401 aa  162  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1569  integrase family protein  32.25 
 
 		 422 aa  133  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1973  integrase family protein  32.92 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0126366 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28.7 
 
 		 390 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.26 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.34 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  24.85 
 
 		 388 aa  94  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.97 
 
 		 400 aa  93.6  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.03 
 
 		 357 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.94 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  30.07 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  22.39 
 
 		 373 aa  87  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  21.64 
 
 		 398 aa  86.3  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  26.67 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  28.53 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  28.88 
 
 		 477 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  23.59 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.65 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  29.55 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.08 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25.3 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  24.14 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  26.52 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  29.32 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  26.35 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.65 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  26.53 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  29.13 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  28.04 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.34 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.78 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  26.67 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.07 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.22 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3933  integrase family protein  23.96 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00343242  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1936  phage integrase family protein  32.39 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0331565  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  26.3 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.15 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  25.82 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  26.21 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  23.45 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  22.9 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  23.27 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  24.7 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  30.07 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  28.05 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.49 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.49 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28.76 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  21.02 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  21.02 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  24.09 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  22.39 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.07 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  27.39 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  29.13 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  24.51 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  25.76 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  22.86 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  23.78 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  26.04 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  31.88 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  30.41 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  31.05 
 
 		 318 aa  67  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  26.17 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  25.76 
 
 		 463 aa  67  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  31 
 
 		 277 aa  67  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  26.9 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  26.76 
 
 		 438 aa  66.2  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.66 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.66 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  22.78 
 
 		 443 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  19.95 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  23.26 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  27.59 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  23.91 
 
 		 344 aa  66.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  23.68 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  22.22 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  22.46 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  24.5 
 
 		 370 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.8 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.37 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  25.91 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  23.71 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  27.78 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3697  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  25.14 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>