107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1973 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1973  integrase family protein  100 
 
 		 450 aa  905    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0126366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  30.61 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3390  phage integrase  30.56 
 
 		 380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5647  integrase family protein  30.75 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  36.19 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1294  integrase family protein  36.4 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1394  integrase family protein  27.95 
 
 		 396 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0589061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  35.79 
 
 		 384 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1457  integrase family protein  30 
 
 		 380 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.32 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1347  phage integrase family protein  28.79 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.68 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1569  integrase family protein  29.32 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0795  integrase family protein  26.48 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  23.71 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  23.3 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  24.76 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.7 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1936  phage integrase family protein  35.12 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0331565  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.21 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  23.22 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  21.29 
 
 		 383 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  25.07 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  25.87 
 
 		 374 aa  56.6  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  25.98 
 
 		 454 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  26.42 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  23.83 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.55 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0749  phage integrase family protein  41.05 
 
 		 182 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.35 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.94 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.94 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  31.84 
 
 		 385 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0545  prophage LambdaSa1, site-specific recombinase phage integrase family protein  23.62 
 
 		 359 aa  53.9  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000831336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  24.32 
 
 		 373 aa  53.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  24.86 
 
 		 438 aa  53.1  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  23.27 
 
 		 386 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2383  integrase family protein  32.68 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  26.5 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.4 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  26.77 
 
 		 371 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  23.33 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  27.81 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  22.93 
 
 		 370 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  24.78 
 
 		 416 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.76 
 
 		 369 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  24.43 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  28.48 
 
 		 451 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  23.15 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  23.55 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  26.95 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  24.07 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  25.2 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  28 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  27.33 
 
 		 362 aa  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  28.8 
 
 		 433 aa  47.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  31.05 
 
 		 396 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.22 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  26.42 
 
 		 396 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  22.69 
 
 		 392 aa  47.4  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  32.63 
 
 		 334 aa  47.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  25 
 
 		 393 aa  47.4  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  24.48 
 
 		 601 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.68 
 
 		 393 aa  46.6  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  29.53 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.21 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.21 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  23.83 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  26.32 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1931  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 218 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0950556  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  23.05 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  24.44 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2498  Phage integrase  24.68 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2403  phage integrase  29.38 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000050364  decreased coverage  0.00000383819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  26.21 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  26.21 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  25.2 
 
 		 506 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0872  phage integrase family protein  23.43 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  24.69 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  24.01 
 
 		 409 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  25.75 
 
 		 292 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  21.43 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  28.75 
 
 		 643 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  45.45 
 
 		 356 aa  45.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1340  phage integrase family protein  28.75 
 
 		 487 aa  45.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  0.929089 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1366  integrase family protein  25.65 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.571831 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  22.68 
 
 		 346 aa  45.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.13 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  24.44 
 
 		 402 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  28.75 
 
 		 644 aa  44.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  28.21 
 
 		 396 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  22.86 
 
 		 405 aa  44.3  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  26.19 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  27.59 
 
 		 460 aa  44.3  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1795  Integrase  23.21 
 
 		 407 aa  43.9  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1417  integrase  24.29 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.542507  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  23.89 
 
 		 349 aa  43.5  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  23.89 
 
 		 349 aa  43.5  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>