277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1294 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1294  integrase family protein  100 
 
 		 393 aa  780    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  47.29 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  46.43 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1457  integrase family protein  41.07 
 
 		 380 aa  245  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1394  integrase family protein  39 
 
 		 396 aa  243  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0589061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3390  phage integrase  41.18 
 
 		 380 aa  222  7e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  40.45 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5647  integrase family protein  37.68 
 
 		 410 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1347  phage integrase family protein  36.76 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1401  hypothetical protein  43.69 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0795  integrase family protein  30.83 
 
 		 401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1973  integrase family protein  36.4 
 
 		 450 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0126366 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1569  integrase family protein  32.47 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.74 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  28.18 
 
 		 416 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  29.18 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  29.57 
 
 		 414 aa  93.6  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  28.57 
 
 		 477 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  30.98 
 
 		 363 aa  89.4  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.32 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.32 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  25 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.22 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.62 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  23.64 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.27 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  27.4 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1936  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0331565  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.56 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  24.47 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  21.89 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  23.28 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  22.94 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  27.5 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  24.93 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  21.66 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.75 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.19 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  21.62 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.65 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.65 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  28.57 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  24.73 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.12 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.97 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.12 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  22.89 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  27.13 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  25.54 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  24.43 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  22.64 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.58 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  24.16 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  29.26 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  31.15 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  24.32 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  30.07 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.71 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  23.99 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  23.46 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  27.17 
 
 		 433 aa  66.2  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  23.33 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  23.77 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  27.91 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  27.5 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  20.79 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  21.08 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  20.91 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  21.66 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  21.16 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  26.78 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  24.51 
 
 		 506 aa  60.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  22.47 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.1 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  21.93 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  23.01 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  29.61 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.98 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  24.68 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  24.53 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  25.77 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.84 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  23.32 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  23 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.44 
 
 		 336 aa  57  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  25.72 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  22.33 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  20.49 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  20.49 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.08 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  24.18 
 
 		 395 aa  55.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.74 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  24.27 
 
 		 452 aa  55.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.24 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  26.11 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  24.22 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  28.43 
 
 		 503 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  25.57 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  25.71 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  26.71 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>