26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0749 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0749  phage integrase family protein  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1936  phage integrase family protein  82.24 
 
 		 194 aa  190  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0331565  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1347  phage integrase family protein  44.52 
 
 		 374 aa  121  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0795  integrase family protein  39.16 
 
 		 401 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1569  integrase family protein  36.62 
 
 		 422 aa  95.9  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3390  phage integrase  36.84 
 
 		 380 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  36.89 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  39.29 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1457  integrase family protein  31.62 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1973  integrase family protein  41.05 
 
 		 450 aa  55.1  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0126366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1394  integrase family protein  32 
 
 		 396 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0589061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5647  integrase family protein  30.71 
 
 		 410 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1294  integrase family protein  29.19 
 
 		 393 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  31.16 
 
 		 370 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 376 aa  48.1  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  32.81 
 
 		 397 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  27.21 
 
 		 384 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.45 
 
 		 376 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.45 
 
 		 376 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.49 
 
 		 376 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.89 
 
 		 392 aa  42.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  30.56 
 
 		 371 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  30.97 
 
 		 363 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  31.36 
 
 		 378 aa  42.4  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.09 
 
 		 325 aa  41.6  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  29.23 
 
 		 376 aa  41.2  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000721683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>