More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0747 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  100 
 
 
325 aa  668    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  47.77 
 
 
400 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  43.99 
 
 
390 aa  262  6e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  44.3 
 
 
414 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  44.48 
 
 
392 aa  260  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  42.05 
 
 
379 aa  239  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  46.62 
 
 
305 aa  236  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  38.29 
 
 
378 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  37.9 
 
 
386 aa  215  8e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  37.42 
 
 
363 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  42.9 
 
 
377 aa  212  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  40.2 
 
 
391 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  38.22 
 
 
370 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  34.6 
 
 
477 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  35.03 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  37.11 
 
 
374 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  37.11 
 
 
374 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  37.66 
 
 
368 aa  195  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  35.74 
 
 
392 aa  188  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  32.29 
 
 
377 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  33.44 
 
 
387 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  37.38 
 
 
383 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  35.49 
 
 
435 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  37.07 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  33.44 
 
 
369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  37.26 
 
 
370 aa  182  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  34.95 
 
 
385 aa  182  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  32.78 
 
 
369 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  33.74 
 
 
391 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  31.9 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  30.55 
 
 
431 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  32.81 
 
 
373 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  33.23 
 
 
376 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  34.06 
 
 
383 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  32.29 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  33.02 
 
 
381 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  32.05 
 
 
371 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  31.23 
 
 
404 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  31.66 
 
 
376 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  31.66 
 
 
376 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  31.33 
 
 
379 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  31.33 
 
 
379 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  30.06 
 
 
463 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  30.27 
 
 
402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  30.09 
 
 
422 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  30.55 
 
 
416 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  31.15 
 
 
381 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  30.43 
 
 
422 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  31.52 
 
 
506 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  31.39 
 
 
388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  26.67 
 
 
406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  33.08 
 
 
471 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  33.08 
 
 
471 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  30.53 
 
 
381 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  31.21 
 
 
416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  27.7 
 
 
407 aa  146  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  31.45 
 
 
391 aa  146  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  33.44 
 
 
374 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  29.25 
 
 
378 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  31.55 
 
 
357 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  29.45 
 
 
403 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  35.86 
 
 
442 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  35.86 
 
 
393 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  30.03 
 
 
409 aa  142  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  33.45 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  27.27 
 
 
413 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  32.55 
 
 
423 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  30.22 
 
 
443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  32.08 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  28.05 
 
 
389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  28.92 
 
 
386 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  29.29 
 
 
507 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  28.15 
 
 
308 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  28.57 
 
 
487 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  28.9 
 
 
656 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  28.03 
 
 
494 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  29.97 
 
 
454 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  27.05 
 
 
437 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3794  integrase family protein  25.34 
 
 
445 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0397442 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.82 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3743  integrase family protein  25.34 
 
 
445 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.05 
 
 
365 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  29.05 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  31.14 
 
 
387 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  27 
 
 
409 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.72 
 
 
451 aa  112  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  25.68 
 
 
395 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  28.53 
 
 
388 aa  109  6e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  27.49 
 
 
398 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  25.64 
 
 
508 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  25.64 
 
 
508 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  26.14 
 
 
407 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  27.33 
 
 
373 aa  105  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  23.28 
 
 
503 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  29.08 
 
 
396 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  39.29 
 
 
429 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  29.23 
 
 
354 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  23.92 
 
 
376 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0597  integrase family protein  26.72 
 
 
447 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.47 
 
 
380 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>