182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0597 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0597  integrase family protein  100 
 
 		 447 aa  909    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  40 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2334  integrase family protein  36.21 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.74243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  30.89 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  29.28 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  28.12 
 
 		 406 aa  113  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.72 
 
 		 325 aa  103  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.39 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  27.62 
 
 		 437 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.17 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  26.45 
 
 		 371 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3743  integrase family protein  28.13 
 
 		 445 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3794  integrase family protein  28.13 
 
 		 445 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0397442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  28.69 
 
 		 422 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  27.51 
 
 		 422 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  28.57 
 
 		 402 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.71 
 
 		 377 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4016  phage integrase family protein  27.35 
 
 		 487 aa  87  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  28 
 
 		 380 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  25.05 
 
 		 507 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  23.97 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.2 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  26.71 
 
 		 377 aa  83.2  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.48 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  23.8 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  22.26 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  22.22 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.89 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  22.91 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.6 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.6 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  27.33 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.6 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.44 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3077  integrase family protein  36.21 
 
 		 242 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.486947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  21.88 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  21.07 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  20.92 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  26.82 
 
 		 407 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  24.15 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  20.9 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  26.83 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  28.05 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  28.05 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  30.25 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.42 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.35 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  21.28 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  20.96 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  27.46 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  27.47 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  22.49 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  25.34 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.77 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.04 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.04 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  26.96 
 
 		 392 aa  57  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  21.13 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  26.89 
 
 		 373 aa  57  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  22.53 
 
 		 398 aa  57  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0370  integrase family protein  33.33 
 
 		 332 aa  57  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  23.33 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  23.56 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  21.41 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  23.26 
 
 		 385 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  19.02 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  28.05 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2865  site-specific recombinase XerD-like  25.19 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.11888  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  21.52 
 
 		 414 aa  54.3  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  23.35 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  42.37 
 
 		 304 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  21.47 
 
 		 401 aa  53.1  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  19.25 
 
 		 308 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  47.17 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0600  phage integrase family protein  39.39 
 
 		 329 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  24.87 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  30.47 
 
 		 331 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  23.75 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  22.85 
 
 		 370 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  27.94 
 
 		 454 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  20.05 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  30.71 
 
 		 301 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  24.25 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  21.19 
 
 		 381 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  40.68 
 
 		 310 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  23.53 
 
 		 370 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  25.84 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  24.7 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  22.81 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  21.57 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  20.9 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  25.23 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  30.67 
 
 		 365 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  25.63 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4020  phage integrase family protein  44.9 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  22.97 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  24.36 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  21.39 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3873  integrase family protein  35.64 
 
 		 439 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00124247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>