261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2334 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2334  integrase family protein  100 
 
 		 444 aa  907    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.74243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  37.94 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0597  integrase family protein  36.21 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  26.04 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  28.85 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.5 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.1 
 
 		 374 aa  96.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.1 
 
 		 374 aa  96.7  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  26.46 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  24.65 
 
 		 371 aa  91.3  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.83 
 
 		 325 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.23 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.42 
 
 		 369 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  23.77 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  25 
 
 		 477 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3794  integrase family protein  23.52 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0397442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3743  integrase family protein  23.52 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  22.78 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.27 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  24.5 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  24.88 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4016  phage integrase family protein  25.21 
 
 		 487 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.19 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  22.99 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.71 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  25.34 
 
 		 507 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  25.55 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  25.52 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  26.48 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.95 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  24.04 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  22.25 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  23.19 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  23.3 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  23.3 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.3 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.45 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  22.25 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  26.33 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.57 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  22.43 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  22.89 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  21.76 
 
 		 388 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  26.11 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  22.89 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  25.78 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  22.35 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  25.29 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.1 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2865  site-specific recombinase XerD-like  23.39 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.11888  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  20.58 
 
 		 301 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  24.52 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  23.99 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  23.84 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  20.41 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  24.78 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  21.18 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3077  integrase family protein  26.49 
 
 		 242 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.486947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  23.93 
 
 		 422 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  24.14 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  24.5 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  23.28 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  22.44 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0546  integrase family protein  22.89 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.849888  hitchhiker  0.000145945 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  21.1 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  21.84 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  21.55 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  33.04 
 
 		 307 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  23.81 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  24.89 
 
 		 334 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  21.24 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  30.71 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  30.71 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  30.71 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  22.44 
 
 		 386 aa  54.3  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  41.51 
 
 		 331 aa  53.9  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3266  phage integrase family protein  29.92 
 
 		 330 aa  53.9  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  22.86 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  23.84 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  23.84 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  23.19 
 
 		 506 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1654  integrase family protein  41.94 
 
 		 298 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  45.61 
 
 		 308 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  40.74 
 
 		 304 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  29.92 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  19.88 
 
 		 376 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  19.88 
 
 		 376 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  42.86 
 
 		 310 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  19.58 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.07 
 
 		 450 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.29 
 
 		 330 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  23.53 
 
 		 429 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1561  site-specific recombinase phage integrase family protein  20.21 
 
 		 418 aa  50.4  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.885578  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  21.55 
 
 		 656 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  36.07 
 
 		 278 aa  50.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.03 
 
 		 315 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.5 
 
 		 330 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  22.83 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  47.83 
 
 		 333 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>