More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1039 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  84.54 
 
 
401 aa  707    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  100 
 
 
401 aa  808    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  100 
 
 
401 aa  808    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  84.54 
 
 
401 aa  707    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1679  integrase  29.76 
 
 
372 aa  133  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0545  prophage LambdaSa1, site-specific recombinase phage integrase family protein  29.78 
 
 
359 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000831336  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0607  integrase  28.68 
 
 
374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  30.7 
 
 
376 aa  124  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000721683  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1417  integrase  28.02 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.542507  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  23.14 
 
 
378 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  28.18 
 
 
369 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  25.31 
 
 
391 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.2 
 
 
369 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.48 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.48 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.92 
 
 
369 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  22.89 
 
 
391 aa  94  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  35.71 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.37 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.15 
 
 
363 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  29.78 
 
 
384 aa  89.4  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  24.44 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  32.46 
 
 
400 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  30.34 
 
 
409 aa  86.3  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  28.72 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  26.04 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  25.97 
 
 
391 aa  84  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.75 
 
 
398 aa  84  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  29.44 
 
 
389 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  26.63 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  28.46 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  26.65 
 
 
391 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  27.03 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  28.21 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  30.6 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  23.98 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  23.2 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  32.22 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  31.55 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  25.76 
 
 
310 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  26.78 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.61 
 
 
325 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  31.32 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.49 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2112  phage integrase family site specific recombinase  29.52 
 
 
494 aa  77  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1993  phage integrase family site specific recombinase  27.87 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  31.32 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  22.67 
 
 
477 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.84 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  29.44 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  33.14 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.51 
 
 
435 aa  73.6  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.47 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  21.91 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0555  phage integrase  30.99 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0470289  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  30.41 
 
 
370 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  28.49 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  27.15 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  29.58 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  22.17 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  26.2 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  23.16 
 
 
463 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  29.88 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  30.64 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  26.2 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  29.56 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  25.28 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  22.01 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  30.32 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  23.95 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  30.54 
 
 
368 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  33.14 
 
 
209 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  27.35 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  28.4 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.93 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  28.4 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  23.01 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  28.57 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  35.22 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.13 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.32 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.13 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.13 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.13 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.13 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.93 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.13 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  25 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.13 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.13 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.13 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  24.31 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  23.65 
 
 
387 aa  67  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  27.37 
 
 
388 aa  67  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  25.75 
 
 
393 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  30.81 
 
 
376 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  24.27 
 
 
295 aa  67  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  25.75 
 
 
442 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  24.61 
 
 
416 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  30.58 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>