More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1690 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1690  integrase  100 
 
 
348 aa  714    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  30 
 
 
374 aa  159  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  32.3 
 
 
313 aa  139  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  33.33 
 
 
310 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0555  phage integrase  32.45 
 
 
308 aa  132  9e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0470289  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2582  integrase  31.05 
 
 
349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000812443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  31.13 
 
 
381 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  30 
 
 
307 aa  123  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  31.87 
 
 
381 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  29.94 
 
 
345 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  29.94 
 
 
345 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  29.63 
 
 
356 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  29.86 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  31.4 
 
 
370 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  29.44 
 
 
369 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  29.5 
 
 
356 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  29.59 
 
 
369 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  28.73 
 
 
381 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1993  phage integrase family site specific recombinase  25.94 
 
 
373 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  28.37 
 
 
362 aa  100  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.52 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.52 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0572  integrase  25.07 
 
 
372 aa  94.4  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000288735  normal  0.557029 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0634  integrase  25.07 
 
 
372 aa  94.4  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000314832  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  27.02 
 
 
369 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  28.13 
 
 
357 aa  93.2  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  26.7 
 
 
357 aa  92.8  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  25.55 
 
 
374 aa  89.7  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.86 
 
 
391 aa  89.4  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  25 
 
 
387 aa  89.4  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  30.4 
 
 
392 aa  88.6  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  27.81 
 
 
370 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.92 
 
 
376 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  28.11 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.48 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  27.48 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.27 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.45 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  27.58 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  25.62 
 
 
385 aa  79.3  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  26.5 
 
 
398 aa  79.3  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.15 
 
 
413 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  23.41 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  26.21 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000721683  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  26.69 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  26.37 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.47 
 
 
392 aa  77  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  23.47 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.97 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  26.64 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.61 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.79 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.27 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.27 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.27 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  26.44 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  27.96 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.93 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  25.51 
 
 
476 aa  72.8  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  24.22 
 
 
388 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.18 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  33.12 
 
 
209 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.06 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  24.3 
 
 
371 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.43 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  27.59 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  30.14 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  23.85 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  25 
 
 
506 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  23.34 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  24.59 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  30 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  23.65 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  25.45 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  22.73 
 
 
409 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  27.44 
 
 
402 aa  67  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  25.35 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  23.86 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  23.86 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  47.62 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  24.76 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  27.68 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  47.62 
 
 
121 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  23.92 
 
 
367 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1986  phage integrase family site specific recombinase  25.93 
 
 
375 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  27.53 
 
 
402 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  24.05 
 
 
401 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  24.24 
 
 
430 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  24.05 
 
 
401 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  24.24 
 
 
430 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  24.66 
 
 
368 aa  63.2  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  27.76 
 
 
368 aa  62.8  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  27.43 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  28.49 
 
 
325 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.32 
 
 
379 aa  62  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1932  integrase/recombinase, phage associated  25.14 
 
 
379 aa  62.8  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.706433  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  28.57 
 
 
401 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  28.57 
 
 
401 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  24.92 
 
 
451 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  24.57 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>