More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4647 on replicon NC_013168
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  100 
 
 		 223 aa  460  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0563  phage integrase family protein  39.15 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00000738062  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0945  phage integrase family protein  39.15 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.237394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2107  integrase family protein  35.94 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.26894 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4273  integrase family protein  35.94 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.42005  normal  0.068032 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  31.02 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  30.11 
 
 		 190 aa  85.1  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  28.19 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0936  phage integrase family protein  40.34 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0566684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  27.66 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  30.46 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  28.26 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  28.19 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  31.1 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  28.72 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  27.13 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0140  hypothetical protein  25.91 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  27.27 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  26.98 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  29.94 
 
 		 308 aa  65.1  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  30.69 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  28.92 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  30.86 
 
 		 317 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  27.18 
 
 		 313 aa  61.6  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.24 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  28.57 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  28.57 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.72 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  27.98 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  29.28 
 
 		 401 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  29.09 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  26.02 
 
 		 400 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  29.1 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  28.03 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  29.38 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  28.42 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  25.44 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  28.42 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  25.31 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  29.38 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  28.42 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  31.61 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  26.14 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.59 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1846  integrase family protein  29.02 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000018136  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  27.18 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  31.9 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  28.21 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  23.67 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  29.34 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  31.74 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  23.3 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  29.35 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  24.44 
 
 		 405 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  27.57 
 
 		 423 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  27.32 
 
 		 292 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  29.19 
 
 		 380 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  25.41 
 
 		 294 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.66 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  24.24 
 
 		 444 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  26.28 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  31.45 
 
 		 329 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  27.04 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.29 
 
 		 324 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  28.48 
 
 		 317 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5043  integrase family protein  30.2 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25.97 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  27.87 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  29.19 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  26.98 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  30.72 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.71 
 
 		 351 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  25.54 
 
 		 309 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.91 
 
 		 300 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  26.09 
 
 		 310 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  27.13 
 
 		 306 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  30.3 
 
 		 310 aa  52.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.91 
 
 		 300 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.91 
 
 		 300 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  27.07 
 
 		 304 aa  52.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  25.56 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  29.52 
 
 		 336 aa  52.4  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 300 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  28.32 
 
 		 289 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  25.13 
 
 		 299 aa  52.4  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  23.93 
 
 		 402 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 331 aa  52.4  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  24.12 
 
 		 304 aa  52.8  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 		 310 aa  52.4  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  29.45 
 
 		 315 aa  52.4  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  27.46 
 
 		 307 aa  52  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  38.6 
 
 		 336 aa  52  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  29.27 
 
 		 310 aa  52  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.59 
 
 		 324 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1228  hypothetical protein  30.15 
 
 		 137 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.95 
 
 		 322 aa  52  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  29.1 
 
 		 305 aa  52  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.88 
 
 		 318 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>