More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1201 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  100 
 
 		 301 aa  617  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  61.46 
 
 		 306 aa  364  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  58.21 
 
 		 304 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  55.71 
 
 		 292 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  48.4 
 
 		 320 aa  294  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  31.89 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  33.22 
 
 		 299 aa  142  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  31.89 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  29.29 
 
 		 315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  30.85 
 
 		 294 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  32.75 
 
 		 314 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  31.77 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  32.27 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  32.66 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  31.85 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  30.07 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  31.47 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  34.47 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  31.47 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  30.07 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  32.53 
 
 		 296 aa  135  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  30.07 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.87 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  30.07 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.87 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  31.47 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  32.59 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.86 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  31.47 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.87 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.24 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.24 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  33.78 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.24 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.24 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.24 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.24 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.24 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.8 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  32.38 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.29 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  31 
 
 		 277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  30.17 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  32.55 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.27 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.03 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  31.02 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  31.89 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  30.43 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  33.6 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  31.74 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  31.84 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  32.53 
 
 		 300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  32.52 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  31.31 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  31.23 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  32.89 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  35 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  32.99 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  30.87 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.1 
 
 		 298 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.1 
 
 		 298 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  31.7 
 
 		 299 aa  128  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.06 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  30.98 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  28.76 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  30.84 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  29.25 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  31.06 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  33.21 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  32.89 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  29.53 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  36.52 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  30.72 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  32.18 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.13 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  31.86 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  29.49 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  33.95 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.89 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.91 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  32.89 
 
 		 307 aa  125  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  31.33 
 
 		 313 aa  125  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.06 
 
 		 298 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  32.39 
 
 		 328 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.03 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.3 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>