More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4591 on replicon NC_013163
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  100 
 
 		 316 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  77.45 
 
 		 313 aa  494  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  66.34 
 
 		 320 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  63.4 
 
 		 311 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  62.75 
 
 		 311 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  55.59 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0645  integrase family protein  41.12 
 
 		 328 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000112195  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1730  integrase family protein  46.93 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4067  integrase/recombinase  42.91 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130649  normal  0.280594 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4229  phage integrase family protein  40.8 
 
 		 329 aa  192  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3221  integrase family protein  41.2 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  hitchhiker  0.000000474252 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0027  integrase/recombinase  39.41 
 
 		 325 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000824478  normal  0.490771 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0180  phage integrase  38.85 
 
 		 336 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0996549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2389  integrase family protein  39.86 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000168042  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2840  integrase family protein  34.56 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.278729 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.23 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4243  phage integrase  32.54 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000426285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3884  phage integrase family site specific recombinase  33.45 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3218  phage integrase family protein  33.45 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104017 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0730  phage integrase  32.88 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5631  integrase/recombinase  44.25 
 
 		 192 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000106041 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  30.98 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2794  integrase family protein  31.77 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.160655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2966  site-specific recombinase, phage integrase family  31.83 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2751  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.67 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74292  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2840  Phage integrase  31.51 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2848  phage integrase family protein  30.66 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2939  integrase family protein  30.31 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2841  phage integrase family site specific recombinase  30.18 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.424466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1900  phage integrase family protein  28.77 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125862  hitchhiker  0.00365877 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  39.57 
 
 		 283 aa  99  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.76 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.76 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.76 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  33.48 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  29.41 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.48 
 
 		 299 aa  92.8  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  32.91 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.49 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  33.93 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.24 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.8 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  30.79 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  37.09 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  32.34 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  31.77 
 
 		 296 aa  89.4  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  30 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  31.58 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  36.61 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.63 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.04 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  38.73 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  34.05 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.59 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.83 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.16 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.53 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.46 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.6 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.24 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  37.16 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  32.16 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  30.99 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  33.78 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  34.93 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  31.84 
 
 		 310 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  31.33 
 
 		 277 aa  87  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  32.14 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1146  tyrosine recombinase XerD  34.21 
 
 		 286 aa  86.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.04 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  33.93 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.9 
 
 		 305 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.48 
 
 		 299 aa  86.3  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.3 
 
 		 333 aa  86.3  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.18 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  30.63 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0369  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.9 
 
 		 305 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0669  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.9 
 
 		 305 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.04 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  35.51 
 
 		 286 aa  85.9  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0118  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.9 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.08 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2504  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.9 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0914  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.9 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0911  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.9 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  27.64 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>