261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0945 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0945  phage integrase family protein  100 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.237394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0563  phage integrase family protein  100 
 
 		 191 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00000738062  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  38.89 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0936  phage integrase family protein  37.93 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0566684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4273  integrase family protein  32.24 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.42005  normal  0.068032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2107  integrase family protein  32.24 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.26894 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  26.53 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  32.24 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  31.65 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  27.89 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  29.51 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  28.79 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  28.57 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  25.41 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.48 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  26.74 
 
 		 608 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  26.74 
 
 		 608 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  26.74 
 
 		 608 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  30.77 
 
 		 617 aa  55.1  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  30.77 
 
 		 617 aa  55.1  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  29.17 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  25.79 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  25.79 
 
 		 273 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  30.17 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  29.35 
 
 		 291 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  31.58 
 
 		 308 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  29.24 
 
 		 301 aa  52.4  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  38.46 
 
 		 365 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  25.93 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  24.31 
 
 		 292 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  24.31 
 
 		 292 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  24.31 
 
 		 292 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.31 
 
 		 355 aa  51.6  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  27.21 
 
 		 326 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  27.04 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  24.06 
 
 		 310 aa  50.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  30.54 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  28 
 
 		 289 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  26.6 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  28.19 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 404 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  25.55 
 
 		 411 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  26.99 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  28.24 
 
 		 391 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  28.57 
 
 		 313 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  30.05 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  32.24 
 
 		 159 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  30.99 
 
 		 291 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  25.53 
 
 		 334 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0789  phage integrase family protein  25.25 
 
 		 444 aa  48.9  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05002  integrase  26.8 
 
 		 345 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0113  resolvase  26.7 
 
 		 258 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189778 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.73 
 
 		 400 aa  48.9  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  23.89 
 
 		 287 aa  48.9  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  29.58 
 
 		 308 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  28.09 
 
 		 310 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 329 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  29.58 
 
 		 308 aa  48.9  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  25.13 
 
 		 296 aa  48.5  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  30 
 
 		 291 aa  48.5  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  28.83 
 
 		 306 aa  48.1  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  27.39 
 
 		 339 aa  48.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  35.56 
 
 		 307 aa  48.1  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 302 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  35.56 
 
 		 307 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  32.21 
 
 		 348 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  25.42 
 
 		 310 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  31.52 
 
 		 401 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  29.17 
 
 		 310 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  31.52 
 
 		 401 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  32.14 
 
 		 400 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  28.49 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2705  integrase family protein  25.14 
 
 		 304 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.800791  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  26.84 
 
 		 409 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  31.87 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.61 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  27.07 
 
 		 335 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  28.49 
 
 		 333 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  31.52 
 
 		 400 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  30.68 
 
 		 444 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  35.56 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 336 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  29.53 
 
 		 310 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5437  integrase family protein  31.07 
 
 		 471 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1228  hypothetical protein  34.85 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  32 
 
 		 467 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  26.23 
 
 		 296 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5043  integrase family protein  31.17 
 
 		 160 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  26.83 
 
 		 338 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  29.14 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  27.39 
 
 		 341 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 324 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  37.5 
 
 		 331 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  26.88 
 
 		 322 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  27.67 
 
 		 395 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  19.59 
 
 		 443 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  35.14 
 
 		 380 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>