More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3470 on replicon NC_012790
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  100 
 
 		 182 aa  380  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  44 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  42.55 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  41.14 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  41.71 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  41.14 
 
 		 180 aa  131  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  40.57 
 
 		 180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  39.43 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  40 
 
 		 182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  38.95 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  35.68 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  37.57 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  40.35 
 
 		 183 aa  120  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  39.18 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  35.47 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  37.89 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  39.23 
 
 		 180 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  36.63 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  39.44 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  37.57 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  35.47 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  36.22 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  33.33 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  36.42 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  36.42 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  36.05 
 
 		 190 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  34.88 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  32.94 
 
 		 176 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  31.18 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  31.18 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  29.44 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  36.31 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  36.31 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  31.76 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  31.76 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  31.76 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  31.76 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  31.76 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  31.76 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  31.76 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  36.76 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  31.76 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0644  phage integrase family protein  32.26 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0659  phage integrase family protein  32.26 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.271524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  27.78 
 
 		 188 aa  87.4  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  27.78 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  27.78 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  27.78 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  27.22 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  27.22 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  27.22 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  26.67 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  26.67 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  32.52 
 
 		 215 aa  84.3  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  34.59 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  31.25 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  28.72 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  31.01 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  28.19 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0438  phage integrase, N-terminus  41.84 
 
 		 97 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0989457  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  32.03 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  29.84 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  29.84 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  29.84 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  31.37 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  31.01 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  29.32 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  31.37 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  31.1 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  26.06 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  29.41 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0393  tyrosine recombinase XerD  29.19 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543195  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  29.41 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  29.41 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  29.41 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2102  integrase family protein  29.3 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  31.61 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  28.76 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  26.58 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3749  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00852374  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  28.75 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  27.39 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 402 aa  62.4  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2671  phage integrase family protein  28 
 
 		 191 aa  62  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1846  integrase family protein  27.54 
 
 		 370 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000018136  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  28.9 
 
 		 293 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0439  phage integrase, C-terminus  42.42 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264159  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  33.55 
 
 		 209 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  35 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2512  type 1 fimbriae regulatory protein  29.86 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  24.34 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  29.11 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.27 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  25.79 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  26.03 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  26.67 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  26.03 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  28.08 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>