More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1075 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  57.37 
 
 		 188 aa  226  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  51.58 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  50.53 
 
 		 188 aa  197  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  49.47 
 
 		 193 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  47.37 
 
 		 190 aa  193  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  37.7 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  39.79 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0140  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  41.45 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  41.97 
 
 		 189 aa  138  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  32.02 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5700  integrase family protein  30.58 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4571  integrase family protein  26.94 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.624666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  31.71 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  34.62 
 
 		 412 aa  72.4  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4358  phage integrase family protein  26.94 
 
 		 221 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.436387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  27.13 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  30.94 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  30.94 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  30.94 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  27.89 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  32.52 
 
 		 288 aa  68.2  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  29.14 
 
 		 292 aa  67  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  29.21 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  30.63 
 
 		 364 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  31.1 
 
 		 285 aa  65.1  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4451  phage integrase  27.55 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  31.36 
 
 		 313 aa  64.7  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3476  integrase family protein  27.72 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0730  phage integrase  29.28 
 
 		 305 aa  64.3  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  33.56 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  33.11 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  29.03 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  29.03 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2709  integrase family protein  32.17 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000251547  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  32 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  32 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  27.91 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.7 
 
 		 282 aa  62  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.47 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  30.05 
 
 		 305 aa  62  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  29.83 
 
 		 295 aa  61.6  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  30 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  25.67 
 
 		 284 aa  61.2  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.41 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  27.32 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.68 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  29.41 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  29.14 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.23 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  32.22 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  27.32 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  29.84 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  29.41 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  27.32 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  29.41 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  27.32 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  29.73 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  28.81 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  28.07 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  26.46 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.51 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  27.59 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5382  phage integrase  28.35 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31221  hitchhiker  0.00239771 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6742  integrase family protein  28.11 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  28.81 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  27.68 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  29.82 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.2 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.48 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.75 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  28.08 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  22.75 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  28.24 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  23.66 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  26.84 
 
 		 309 aa  58.2  0.00000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  30 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3189  integrase family protein  30.34 
 
 		 345 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000247196  hitchhiker  0.000000000920932 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0123  hypothetical protein  40.91 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.65 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  26.6 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  29.34 
 
 		 294 aa  58.2  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.13 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.95 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1673  integrase family protein  25.29 
 
 		 374 aa  57.8  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000152851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>