More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4462 on replicon NC_011721
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  100 
 
 		 311 aa  631  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  97.43 
 
 		 311 aa  617  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  64.08 
 
 		 313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  63.4 
 
 		 316 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  63.4 
 
 		 320 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  55.67 
 
 		 309 aa  318  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1730  integrase family protein  47.1 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0645  integrase family protein  41.81 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000112195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4067  integrase/recombinase  42.35 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130649  normal  0.280594 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0027  integrase/recombinase  42.76 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000824478  normal  0.490771 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0180  phage integrase  39.46 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0996549 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4229  phage integrase family protein  40.86 
 
 		 329 aa  192  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3221  integrase family protein  41.67 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  hitchhiker  0.000000474252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2389  integrase family protein  40.31 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000168042  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2840  integrase family protein  36.91 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.278729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2966  site-specific recombinase, phage integrase family  36.33 
 
 		 321 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2794  integrase family protein  35.86 
 
 		 304 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.160655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2751  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  35.37 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74292  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5631  integrase/recombinase  48.24 
 
 		 192 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000106041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4243  phage integrase  32.77 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000426285 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.12 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2840  Phage integrase  35.27 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3884  phage integrase family site specific recombinase  32.34 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3218  phage integrase family protein  32.34 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104017 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0730  phage integrase  31.44 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2848  phage integrase family protein  35.19 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2939  integrase family protein  34.53 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2841  phage integrase family site specific recombinase  35.64 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.424466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1900  phage integrase family protein  29.24 
 
 		 331 aa  125  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125862  hitchhiker  0.00365877 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  32.93 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.79 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  34.19 
 
 		 283 aa  95.9  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  32.74 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  36.05 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.05 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  27.46 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  32.58 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  33.73 
 
 		 254 aa  93.6  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  32.74 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  33.04 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.27 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  37.57 
 
 		 295 aa  92.4  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  31.7 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.72 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  35.43 
 
 		 292 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.87 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.27 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  36.04 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  32.16 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  32.92 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  32.82 
 
 		 283 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.72 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  29.96 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.04 
 
 		 336 aa  90.1  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.73 
 
 		 298 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.6 
 
 		 303 aa  89.7  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.6 
 
 		 303 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1196  tyrosine recombinase XerD  34.5 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0670859  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.6 
 
 		 303 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  30.63 
 
 		 307 aa  89.4  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  32.74 
 
 		 296 aa  89.4  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.93 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  33.48 
 
 		 304 aa  89  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  34.3 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.81 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  31.86 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  28.62 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  31.03 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.47 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  31.08 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  32.88 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.47 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  41.06 
 
 		 443 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  29.96 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.47 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  30.63 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  31.88 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  34.62 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  31.34 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.4 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.4 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  32.64 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.4 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  28.32 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  29.2 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  33.71 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  33.48 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  30.13 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  28.14 
 
 		 304 aa  86.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  31.82 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.07 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  32.89 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.87 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  33.94 
 
 		 311 aa  86.3  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 306 aa  85.9  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  28.31 
 
 		 305 aa  86.3  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4646  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.82 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>