More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2709 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2709  integrase family protein  100 
 
 		 210 aa  431  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000251547  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  34.97 
 
 		 295 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  34.5 
 
 		 295 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.36 
 
 		 329 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  37.65 
 
 		 295 aa  96.3  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  36.31 
 
 		 306 aa  96.3  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.9 
 
 		 351 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.36 
 
 		 323 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  35.43 
 
 		 302 aa  94.7  8e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  34.5 
 
 		 298 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.29 
 
 		 321 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  32.24 
 
 		 323 aa  94.4  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  33.7 
 
 		 302 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  34.08 
 
 		 302 aa  93.2  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  35.47 
 
 		 317 aa  92  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  34.57 
 
 		 295 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  37.5 
 
 		 320 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  31.98 
 
 		 294 aa  91.7  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  29.05 
 
 		 307 aa  91.3  9e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  33.16 
 
 		 310 aa  91.3  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  37.65 
 
 		 367 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.71 
 
 		 300 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  30.48 
 
 		 338 aa  90.1  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  35.37 
 
 		 313 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  38.82 
 
 		 365 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  32.37 
 
 		 298 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  33.52 
 
 		 296 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  38.82 
 
 		 365 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  32.94 
 
 		 295 aa  89.4  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  37.58 
 
 		 302 aa  89.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  32.39 
 
 		 295 aa  89.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  34.43 
 
 		 322 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  32.39 
 
 		 295 aa  89.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  32.04 
 
 		 353 aa  89.7  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  33.68 
 
 		 309 aa  89.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  32.04 
 
 		 354 aa  89.7  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  27.92 
 
 		 328 aa  89  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  36.71 
 
 		 314 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  33.53 
 
 		 295 aa  88.6  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  31.87 
 
 		 310 aa  88.6  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  34.92 
 
 		 302 aa  88.2  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  32.24 
 
 		 284 aa  88.2  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.5 
 
 		 328 aa  88.2  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  35.8 
 
 		 302 aa  88.2  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.72 
 
 		 330 aa  88.2  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  35.33 
 
 		 296 aa  88.2  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  33.33 
 
 		 309 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  33.91 
 
 		 314 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  34.92 
 
 		 302 aa  88.2  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 298 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.41 
 
 		 308 aa  87.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 324 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  31.46 
 
 		 295 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1177  integrase family protein  32.45 
 
 		 329 aa  87.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  35.93 
 
 		 297 aa  87.8  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  34.12 
 
 		 307 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  35.03 
 
 		 319 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.68 
 
 		 299 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  31.32 
 
 		 297 aa  87.8  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  32.75 
 
 		 317 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  34.16 
 
 		 303 aa  87  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.58 
 
 		 313 aa  87  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  33.73 
 
 		 290 aa  87  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  31.28 
 
 		 299 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.96 
 
 		 330 aa  86.7  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  35.48 
 
 		 323 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  33.14 
 
 		 395 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  32.8 
 
 		 305 aa  86.3  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  34.67 
 
 		 353 aa  86.3  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  32.95 
 
 		 277 aa  86.3  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 302 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  32.53 
 
 		 317 aa  86.3  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  32.8 
 
 		 299 aa  85.9  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.55 
 
 		 324 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  31.68 
 
 		 320 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  32.93 
 
 		 299 aa  85.9  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  31.38 
 
 		 309 aa  85.5  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  31.9 
 
 		 307 aa  85.5  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  30.54 
 
 		 308 aa  85.5  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  34.21 
 
 		 342 aa  85.5  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  32.56 
 
 		 308 aa  85.1  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.24 
 
 		 450 aa  85.1  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  35.62 
 
 		 309 aa  85.1  7e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.24 
 
 		 450 aa  84.7  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  31.25 
 
 		 293 aa  84.7  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.67 
 
 		 300 aa  84.7  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  32.53 
 
 		 299 aa  84.7  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  31.87 
 
 		 354 aa  84.7  9e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.55 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.25 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  33.74 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.09 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  30.46 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  34.36 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  29.44 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  33.33 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  32.42 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  31.82 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  33.99 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  31.92 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>