More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00295 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  100 
 
 		 297 aa  610  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0730  phage integrase  52.53 
 
 		 305 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  52.86 
 
 		 311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3218  phage integrase family protein  52.86 
 
 		 310 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3884  phage integrase family site specific recombinase  53.2 
 
 		 310 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4243  phage integrase  39.33 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000426285 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  34.58 
 
 		 313 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  35.23 
 
 		 316 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  35.45 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  35.12 
 
 		 311 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  32.2 
 
 		 320 aa  149  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3221  integrase family protein  31.74 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  hitchhiker  0.000000474252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0645  integrase family protein  32.09 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000112195  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2794  integrase family protein  31.13 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.160655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4229  phage integrase family protein  31.4 
 
 		 329 aa  135  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  31.16 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0027  integrase/recombinase  31.53 
 
 		 325 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000824478  normal  0.490771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1730  integrase family protein  28.88 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2840  integrase family protein  27.46 
 
 		 322 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.278729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2966  site-specific recombinase, phage integrase family  30.69 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2751  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.34 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74292  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2840  Phage integrase  28.33 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0180  phage integrase  29.08 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0996549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2848  phage integrase family protein  28.77 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4067  integrase/recombinase  27.5 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130649  normal  0.280594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2841  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.424466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2939  integrase family protein  28.42 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2389  integrase family protein  29.83 
 
 		 345 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000168042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.72 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1900  phage integrase family protein  28.04 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125862  hitchhiker  0.00365877 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1247  Phage integrase  30.74 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  28.08 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  33.48 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  31.08 
 
 		 311 aa  94.7  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  31.28 
 
 		 315 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  28.87 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2807  Phage integrase  27.34 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  32.35 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  32.35 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  37.11 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.14 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  31.4 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.9 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  31.87 
 
 		 313 aa  89  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  30.6 
 
 		 318 aa  89  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.92 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  30.9 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  28.89 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  27.91 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.57 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  29.32 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.32 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  31.15 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  29.17 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.65 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  27.56 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  28.44 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.93 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2258  tyrosine recombinase XerD  33.19 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.47 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  28.76 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  27.8 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  29.3 
 
 		 303 aa  85.9  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  29.12 
 
 		 295 aa  85.5  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  31.74 
 
 		 321 aa  85.5  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  29.12 
 
 		 295 aa  85.5  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.62 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.96 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.6 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.6 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.6 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.6 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.47 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.6 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  30.53 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.96 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.96 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  25.98 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.28 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.28 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  28.46 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.44 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  29.18 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  28.21 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.28 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  29.96 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  29.91 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.44 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.28 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  32.46 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.44 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  30.49 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.14 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  32.8 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.74 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  30.91 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>