More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3221 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3221  integrase family protein  100 
 
 		 337 aa  672    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  hitchhiker  0.000000474252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4067  integrase/recombinase  62.42 
 
 		 324 aa  362  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130649  normal  0.280594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1730  integrase family protein  59.75 
 
 		 317 aa  348  7e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2389  integrase family protein  47.98 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000168042  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  42.9 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  42.19 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  42 
 
 		 311 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  41.67 
 
 		 311 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  40.53 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  41.2 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4229  phage integrase family protein  39.87 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0027  integrase/recombinase  37.99 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000824478  normal  0.490771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0645  integrase family protein  39.1 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000112195  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0180  phage integrase  35.76 
 
 		 336 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0996549 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2840  integrase family protein  34.49 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.278729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2794  integrase family protein  35.97 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.160655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2751  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  34.39 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74292  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.74 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4243  phage integrase  33.55 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000426285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2966  site-specific recombinase, phage integrase family  33.44 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2840  Phage integrase  33.01 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0730  phage integrase  29.04 
 
 		 305 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3218  phage integrase family protein  33.56 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3884  phage integrase family site specific recombinase  33.56 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2848  phage integrase family protein  35.53 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 311 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2939  integrase family protein  33.55 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2841  phage integrase family site specific recombinase  35.49 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.424466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1900  phage integrase family protein  26.12 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125862  hitchhiker  0.00365877 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  35 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  30.41 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  30.41 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  36.61 
 
 		 295 aa  95.9  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.63 
 
 		 322 aa  95.1  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  31.62 
 
 		 305 aa  93.6  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  32.93 
 
 		 324 aa  93.2  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  31.02 
 
 		 313 aa  92.8  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  32.65 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  30.41 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.08 
 
 		 355 aa  89.7  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  29.65 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.23 
 
 		 301 aa  89.7  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  32.21 
 
 		 292 aa  89.4  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0872  integrase family protein  31.63 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  33.99 
 
 		 301 aa  87.8  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  33.62 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  28.32 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  38.41 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.47 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.02 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.02 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.02 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.02 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  31 
 
 		 290 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  36.75 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  29.96 
 
 		 309 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  33.15 
 
 		 302 aa  85.9  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  27.42 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  33.15 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.4 
 
 		 299 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  34.67 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.02 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.02 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.61 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  27.24 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  34.18 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.4 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.02 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.61 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  28.62 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.61 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  31.69 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  32.98 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  34.22 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  34.97 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  37.58 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  37.36 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  37.36 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.53 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1209  phage integrase family site specific recombinase  32.26 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.764611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  36.59 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  31.9 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  30.6 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  35.45 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  34 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  34.13 
 
 		 297 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  39.24 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0902  integrase family protein  36.2 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  33.12 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  36.05 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  36.54 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  34.41 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  37.33 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  32.71 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.6 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  35.37 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.268843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>