More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1730 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1730  integrase family protein  100 
 
 		 317 aa  629  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4067  integrase/recombinase  72.36 
 
 		 324 aa  435  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130649  normal  0.280594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3221  integrase family protein  59.75 
 
 		 337 aa  357  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  hitchhiker  0.000000474252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2389  integrase family protein  54.69 
 
 		 345 aa  273  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000168042  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  48.46 
 
 		 311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  47.12 
 
 		 313 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  47.44 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  46.62 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  46.62 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  47.3 
 
 		 316 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0645  integrase family protein  45.03 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000112195  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0027  integrase/recombinase  42.12 
 
 		 325 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000824478  normal  0.490771 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4229  phage integrase family protein  41.36 
 
 		 329 aa  202  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0180  phage integrase  36.14 
 
 		 336 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0996549 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2840  integrase family protein  38.1 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.278729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2794  integrase family protein  36.54 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.160655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2751  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  35.46 
 
 		 321 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74292  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2966  site-specific recombinase, phage integrase family  35.44 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2848  phage integrase family protein  37.42 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2939  integrase family protein  37.75 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2841  phage integrase family site specific recombinase  37.93 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.424466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2840  Phage integrase  35.62 
 
 		 296 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4243  phage integrase  33 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000426285 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.05 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3218  phage integrase family protein  31.21 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3884  phage integrase family site specific recombinase  30.87 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0730  phage integrase  28.47 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1900  phage integrase family protein  27.89 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125862  hitchhiker  0.00365877 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.38 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  36.46 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  33.47 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  35.96 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.74 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.03 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5631  integrase/recombinase  36.69 
 
 		 192 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000106041 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.24 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.39 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  34.17 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.39 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  34.59 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  35.81 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.24 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.3 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.3 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  32.9 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  32.76 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  32.62 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  31.87 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.3 
 
 		 296 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.3 
 
 		 296 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.3 
 
 		 296 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  34.05 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.3 
 
 		 296 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  33.9 
 
 		 294 aa  90.5  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.3 
 
 		 296 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  31.87 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  28.4 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  31.67 
 
 		 290 aa  90.1  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  33.93 
 
 		 302 aa  89.4  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  31.06 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  29.84 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  36.36 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  35.44 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.88 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  34.73 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  34.09 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  30.24 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  32.77 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  35.4 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  37.82 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  39.26 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  28.87 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  34.09 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.25 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  36.11 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  35.06 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  32.1 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  35.32 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  29.91 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  33.2 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  35.71 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  31.32 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  39.1 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0540  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.19 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0147694  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  29 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  38.55 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1209  phage integrase family site specific recombinase  29.71 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.764611  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  26.56 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.24 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.24 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  36.48 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  33.63 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  33.64 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.24 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  32.81 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  37.97 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  33.78 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>