40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5631 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5631  integrase/recombinase  100 
 
 		 192 aa  394  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000106041 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  48.26 
 
 		 311 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  48.24 
 
 		 311 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  44.25 
 
 		 316 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  44.71 
 
 		 313 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  48.12 
 
 		 309 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  45.93 
 
 		 320 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0645  integrase family protein  36.61 
 
 		 328 aa  104  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000112195  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0027  integrase/recombinase  38.36 
 
 		 325 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000824478  normal  0.490771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1730  integrase family protein  36.69 
 
 		 317 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4067  integrase/recombinase  36.69 
 
 		 324 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130649  normal  0.280594 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4229  phage integrase family protein  37.11 
 
 		 329 aa  90.5  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2389  integrase family protein  33.33 
 
 		 345 aa  84.7  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000168042  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0180  phage integrase  34.59 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0996549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2751  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  33.73 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74292  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2966  site-specific recombinase, phage integrase family  33.13 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2794  integrase family protein  32.34 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.160655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4243  phage integrase  31.06 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000426285 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2848  phage integrase family protein  30.54 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2939  integrase family protein  30.54 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3221  integrase family protein  37.43 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  hitchhiker  0.000000474252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2840  Phage integrase  30.77 
 
 		 296 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2841  phage integrase family site specific recombinase  29.68 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.424466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2840  integrase family protein  28.93 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.278729 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1900  phage integrase family protein  30.82 
 
 		 331 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125862  hitchhiker  0.00365877 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.04 
 
 		 297 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3884  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 310 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0730  phage integrase  25.47 
 
 		 305 aa  50.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3218  phage integrase family protein  25 
 
 		 310 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  28.4 
 
 		 309 aa  48.9  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4563  integrase domain protein SAM domain protein  26.74 
 
 		 314 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  50 
 
 		 291 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  25 
 
 		 311 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0423  integrase family protein  30.92 
 
 		 304 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.4 
 
 		 299 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  27.85 
 
 		 307 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  25.14 
 
 		 362 aa  42.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4572  integrase family protein  23.02 
 
 		 373 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5541  integrase family protein  29.5 
 
 		 329 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0614894 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  29.47 
 
 		 302 aa  41.2  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>