More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07060 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  100 
 
 		 315 aa  649    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  55.4 
 
 		 323 aa  318  9e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  51.33 
 
 		 313 aa  311  6.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  44.74 
 
 		 305 aa  256  5e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  39.13 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  39.13 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  39.46 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  37.99 
 
 		 300 aa  199  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  39.86 
 
 		 294 aa  196  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  41.58 
 
 		 293 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  38.46 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  36.24 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  37.38 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  37.01 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  37.01 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  36.57 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  39.09 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  37.01 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.76 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  40.89 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  37.01 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  36.6 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  36.04 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  37.91 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  37.91 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  37.05 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  38.05 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.07 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.48 
 
 		 300 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  36.54 
 
 		 300 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.76 
 
 		 299 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.72 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.07 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.07 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.07 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.07 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  37.75 
 
 		 313 aa  186  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.07 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  36.54 
 
 		 300 aa  185  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.07 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  37.02 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  37.3 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  36.1 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  37.25 
 
 		 302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  36.22 
 
 		 300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  36.83 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  36.77 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.72 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  38.38 
 
 		 292 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  35.44 
 
 		 296 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  39.68 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  35.88 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  35.28 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  35.58 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  36.57 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  36.89 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  38.41 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  35.1 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  35.76 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  34.84 
 
 		 296 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  38.11 
 
 		 317 aa  178  9e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  35.5 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  36.3 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  34.32 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  37.92 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  33.22 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  34.84 
 
 		 304 aa  175  9e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  33.75 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  38.39 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  36.91 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  35.5 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  35.41 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  35.41 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  35.76 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  36.33 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  37.84 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  36.12 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  37.04 
 
 		 292 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  38.11 
 
 		 310 aa  172  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  35.1 
 
 		 314 aa  172  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  38.31 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  36.18 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.25 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  35.95 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  33 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  36.03 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.03 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  35.58 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.33 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  33.12 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  35.02 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.92 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.92 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  36.88 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  39.92 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  38 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  35.49 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  35.06 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  36.33 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.92 
 
 		 296 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>