More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_0116 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  100 
 
 
309 aa  631  1e-180  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  76.38 
 
 
309 aa  505  9.999999999999999e-143  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  46.58 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  38.14 
 
 
319 aa  236  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.48 
 
 
313 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  36.98 
 
 
339 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  37.54 
 
 
321 aa  222  4.9999999999999996e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  41.83 
 
 
305 aa  220  3e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3598  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.62 
 
 
317 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.54 
 
 
308 aa  215  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.8 
 
 
298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  38.8 
 
 
298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.8 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.8 
 
 
298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  38.8 
 
 
298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.8 
 
 
298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.8 
 
 
298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1634  integrase family protein  35.74 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.8 
 
 
298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.8 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  36.34 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3891  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.62 
 
 
317 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125291  decreased coverage  0.00274094 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.8 
 
 
298 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0296  tyrosine recombinase XerD  35.78 
 
 
351 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7575  tyrosine recombinase XerD subunit  35.26 
 
 
308 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0393  tyrosine recombinase XerD  35.13 
 
 
319 aa  209  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543195  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.94 
 
 
299 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.94 
 
 
299 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.94 
 
 
299 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.33 
 
 
298 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1468  phage integrase family protein  36.6 
 
 
304 aa  209  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  37.79 
 
 
299 aa  209  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  35.85 
 
 
325 aa  208  8e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  34.41 
 
 
332 aa  208  9e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.13 
 
 
298 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0907  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.33 
 
 
307 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0724  integrase family protein  37.34 
 
 
308 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.13 
 
 
298 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.13 
 
 
298 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.13 
 
 
298 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.13 
 
 
298 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.62 
 
 
299 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  35.13 
 
 
319 aa  206  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  38.46 
 
 
299 aa  205  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.95 
 
 
299 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4056  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.28 
 
 
332 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3738  tyrosine recombinase XerD subunit  34.21 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.96 
 
 
298 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  33.87 
 
 
328 aa  199  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  38.21 
 
 
300 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  34.19 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.63 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.96 
 
 
298 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.91 
 
 
298 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0533  tyrosine recombinase XerD  33.23 
 
 
347 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  35.97 
 
 
298 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  36.54 
 
 
307 aa  194  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.3 
 
 
298 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  35.62 
 
 
304 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  34.08 
 
 
311 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.74 
 
 
297 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.63 
 
 
302 aa  193  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.64 
 
 
298 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.64 
 
 
298 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.42 
 
 
305 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.71 
 
 
298 aa  192  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.64 
 
 
298 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0677  integrase family protein  35.53 
 
 
291 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.92563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.53 
 
 
298 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  36.22 
 
 
307 aa  192  9e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  37.67 
 
 
305 aa  191  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.12 
 
 
300 aa  191  9e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  37.21 
 
 
303 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.58 
 
 
296 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.58 
 
 
296 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.58 
 
 
296 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.58 
 
 
296 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  32.69 
 
 
308 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.97 
 
 
298 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.58 
 
 
296 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.91 
 
 
296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.91 
 
 
299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  34.28 
 
 
312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2031  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.69 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 
296 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 
296 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 
296 aa  188  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 
296 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2172  tyrosine recombinase XerD  35.05 
 
 
309 aa  188  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.178894 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  36.98 
 
 
303 aa  188  9e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  36.63 
 
 
307 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1953  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.37 
 
 
307 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  37.38 
 
 
302 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  32.8 
 
 
311 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  31.72 
 
 
310 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  35.74 
 
 
296 aa  186  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  32.48 
 
 
311 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  34.19 
 
 
301 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  36.09 
 
 
303 aa  186  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  37.09 
 
 
302 aa  186  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>