More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0039 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  100 
 
 		 312 aa  644    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0907  site-specific tyrosine recombinase XerD  59.55 
 
 		 307 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  56.82 
 
 		 308 aa  338  5e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  54.75 
 
 		 313 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1953  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.58 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2031  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.25 
 
 		 307 aa  308  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3598  site-specific tyrosine recombinase XerD  52.72 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3891  site-specific tyrosine recombinase XerD  52.08 
 
 		 317 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125291  decreased coverage  0.00274094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4056  site-specific tyrosine recombinase XerD  50.62 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  49.84 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  51.49 
 
 		 339 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  47.23 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0296  tyrosine recombinase XerD  48.05 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  46.93 
 
 		 320 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7575  tyrosine recombinase XerD subunit  46.71 
 
 		 308 aa  262  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0393  tyrosine recombinase XerD  46.93 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543195  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  47.49 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  46.71 
 
 		 319 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  47.27 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  47.67 
 
 		 328 aa  255  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  47.67 
 
 		 328 aa  255  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0533  tyrosine recombinase XerD  47.08 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  46.5 
 
 		 321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3738  tyrosine recombinase XerD subunit  47.37 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1134  tyrosine recombinase XerD  48.68 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1634  integrase family protein  45.03 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2172  tyrosine recombinase XerD  46.75 
 
 		 309 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.178894 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1797  phage integrase  47.42 
 
 		 303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.742134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0677  integrase family protein  48.65 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.92563 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  44.19 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  42.72 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  44.67 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  42.39 
 
 		 311 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  42.07 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  42.72 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0724  integrase family protein  43.65 
 
 		 308 aa  228  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1279  phage integrase family protein  45.51 
 
 		 323 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0644752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0011  phage integrase family protein  43.04 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  44.6 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  44.78 
 
 		 304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  42.76 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1468  phage integrase family protein  44.26 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.35 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.35 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.35 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  41.97 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.3 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.32 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.3 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.3 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.3 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.3 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.35 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  41.35 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  41.35 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.35 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.35 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.35 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.35 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.29 
 
 		 298 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.97 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  38.61 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  40.84 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.35 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.65 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.49 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  40.71 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.32 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.19 
 
 		 299 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.13 
 
 		 305 aa  195  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  35.48 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.19 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  39.49 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  41.35 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  34.28 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.58 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  40.19 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  39.8 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  37.79 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  39.48 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.72 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  39.53 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  40.45 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.52 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  36.72 
 
 		 295 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  36.72 
 
 		 295 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  39.87 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  38.24 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  39.6 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  39.02 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1488  tyrosine recombinase XerD  39.27 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  39.48 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.35 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0895  tyrosine recombinase XerD  40.98 
 
 		 308 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  36.77 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  37.22 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  32.19 
 
 		 328 aa  178  8e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.54 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>