More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1902 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  100 
 
 		 293 aa  570  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0011  phage integrase family protein  59.09 
 
 		 301 aa  304  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1797  phage integrase  60.63 
 
 		 303 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.742134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  51.16 
 
 		 321 aa  256  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  49.5 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  47.39 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3738  tyrosine recombinase XerD subunit  50.49 
 
 		 328 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  44.67 
 
 		 312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  48.34 
 
 		 339 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0907  site-specific tyrosine recombinase XerD  47.51 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  44.52 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0296  tyrosine recombinase XerD  45.78 
 
 		 351 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  45.74 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7575  tyrosine recombinase XerD subunit  43.61 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0393  tyrosine recombinase XerD  46.73 
 
 		 319 aa  222  7e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543195  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  44.12 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.82 
 
 		 313 aa  221  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  46.44 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4056  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.48 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0724  integrase family protein  46.73 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1634  integrase family protein  44.55 
 
 		 354 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3598  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.87 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0533  tyrosine recombinase XerD  44.48 
 
 		 347 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3891  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.2 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125291  decreased coverage  0.00274094 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  44.3 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  47.69 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  44.3 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1279  phage integrase family protein  47.71 
 
 		 323 aa  211  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0644752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  45.7 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1953  site-specific tyrosine recombinase XerD  47.51 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  46.78 
 
 		 328 aa  208  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  46.78 
 
 		 328 aa  208  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  44.7 
 
 		 308 aa  208  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_004310  BR2031  site-specific tyrosine recombinase XerD  47.51 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  43.18 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  41 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  37.29 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  44.55 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  47.14 
 
 		 304 aa  199  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.03 
 
 		 298 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1468  phage integrase family protein  45.45 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.03 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.03 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.03 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.03 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.69 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  41.69 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.69 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.69 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.64 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.69 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  41.69 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.69 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0677  integrase family protein  46.74 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.92563 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  39.67 
 
 		 305 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.68 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.68 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.02 
 
 		 298 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.68 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.36 
 
 		 298 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  39.67 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2172  tyrosine recombinase XerD  46.78 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.178894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  39.26 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.44 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  38.33 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.67 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  41.33 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  36.42 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.28 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  38.08 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  36.75 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1134  tyrosine recombinase XerD  46.44 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  43.14 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  37.95 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  40.61 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.96 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.27 
 
 		 299 aa  188  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  33.67 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  36.09 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  38.46 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.09 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.09 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.09 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.09 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  39.54 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.09 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.09 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.09 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.09 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  41.55 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.09 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.44 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.19 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0895  tyrosine recombinase XerD  41.22 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  37.37 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  41.81 
 
 		 312 aa  185  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 296 aa  185  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  39.32 
 
 		 299 aa  185  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 305 aa  185  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.03 
 
 		 299 aa  185  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>