More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5700 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5700  integrase family protein  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4451  phage integrase  50.45 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6742  integrase family protein  51.9 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5382  phage integrase  46.67 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31221  hitchhiker  0.00239771 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4571  integrase family protein  34.13 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.624666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4358  phage integrase family protein  30.29 
 
 		 221 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.436387  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0140  hypothetical protein  33.03 
 
 		 194 aa  99.8  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  34.86 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  33.51 
 
 		 188 aa  92.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  32.24 
 
 		 190 aa  92.4  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  34.03 
 
 		 188 aa  90.1  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  30.91 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  31.53 
 
 		 189 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  32.27 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  32.69 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  29.09 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  30.32 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  30.58 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1565  phage integrase family protein  28.11 
 
 		 317 aa  68.6  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210846  normal  0.0264198 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2245  hypothetical protein  29.2 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.468605 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  27.19 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  32.99 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2565  hypothetical protein  29.15 
 
 		 317 aa  65.1  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  30.52 
 
 		 303 aa  65.1  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  26.94 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3447  integrase family protein  30.41 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  31.63 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  29.9 
 
 		 299 aa  62  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  29.17 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  29.52 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  29.09 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  29.67 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.72 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  30.19 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.12 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  26.29 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  27.4 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  27.52 
 
 		 292 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  27.23 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.37 
 
 		 311 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.19 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  26.82 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  29.63 
 
 		 332 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0540  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.83 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0147694  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  26.78 
 
 		 329 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.61 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  25.79 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.37 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  27.91 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4897  integrase family protein  30.73 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  26.82 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  26.82 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  26.82 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.37 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  24.54 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.3 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.43 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.4 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  28.11 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.73 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  27.8 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  27.15 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.05 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.8 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.49 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.01 
 
 		 298 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  28.16 
 
 		 297 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.61 
 
 		 296 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.48 
 
 		 315 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  25.58 
 
 		 292 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.61 
 
 		 296 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.61 
 
 		 296 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.73 
 
 		 299 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.73 
 
 		 299 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  27.73 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  28.44 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.73 
 
 		 299 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  28.51 
 
 		 321 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  27.98 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.61 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  25.69 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  27.57 
 
 		 307 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  26.54 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.15 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.15 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0182  integrase/recombinase  25.54 
 
 		 317 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.44216  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.73 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.15 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  29.49 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  26.87 
 
 		 295 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  28.37 
 
 		 304 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  30.48 
 
 		 328 aa  53.5  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>