More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3447 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3447  integrase family protein  100 
 
 		 324 aa  646    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2194  integrase family protein  58.2 
 
 		 329 aa  334  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000240835  hitchhiker  0.000237132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2334  phage integrase family protein  56.15 
 
 		 322 aa  308  9e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113164 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3189  integrase family protein  53.11 
 
 		 345 aa  302  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000247196  hitchhiker  0.000000000920932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2477  integrase family protein  56.15 
 
 		 330 aa  302  5.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380932  normal  0.877994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4455  integrase family protein  54.02 
 
 		 339 aa  288  9e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000000349863  hitchhiker  0.00111504 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  33.68 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  32.45 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  29.9 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  32.75 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  28.17 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  31.21 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  27.11 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  30.36 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.18 
 
 		 301 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  27.06 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  30.08 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  28.01 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  31.47 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  29.24 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  36.14 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.15 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  32.24 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.15 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.15 
 
 		 299 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.15 
 
 		 299 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  28.23 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.49 
 
 		 299 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.62 
 
 		 321 aa  99.4  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.8 
 
 		 299 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.49 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  32.42 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.22 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  27.74 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.15 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  29.22 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.49 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.47 
 
 		 330 aa  96.3  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 296 aa  96.7  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  30.88 
 
 		 328 aa  96.3  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0928  integrase family protein  33.11 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.46 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  33.56 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.63 
 
 		 300 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  32.76 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  28.29 
 
 		 309 aa  94.4  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  27.18 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.91 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.91 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.37 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.39 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  27.18 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  29.64 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  34.15 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  28.19 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  30.66 
 
 		 294 aa  93.6  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 310 aa  93.2  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  32.38 
 
 		 295 aa  92.8  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.78 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  29.71 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  28.62 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  29.43 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  34.39 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  28.38 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  34.4 
 
 		 343 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  32.86 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  30.58 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  28.87 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  33.57 
 
 		 293 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  30.59 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  31.79 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  29.31 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.53 
 
 		 322 aa  90.5  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  30.6 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  34.4 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  32.48 
 
 		 317 aa  90.5  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  26.33 
 
 		 297 aa  90.1  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  25.71 
 
 		 296 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  26.41 
 
 		 301 aa  89.4  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  27.24 
 
 		 310 aa  89.4  8e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  27.99 
 
 		 274 aa  89  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  28.47 
 
 		 307 aa  89.4  9e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.12 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  27.8 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  25.99 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2383  integrase family protein  32.17 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000443336  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  29.02 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.82 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  30.88 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  29.14 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  34.08 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  31.14 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  25.39 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  28.81 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  25.87 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  28.21 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>