More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4455 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4455  integrase family protein  100 
 
 
339 aa  662    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000000349863  hitchhiker  0.00111504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2194  integrase family protein  59.69 
 
 
329 aa  342  7e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000240835  hitchhiker  0.000237132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3447  integrase family protein  53.92 
 
 
324 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3189  integrase family protein  51.4 
 
 
345 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000247196  hitchhiker  0.000000000920932 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2334  phage integrase family protein  49.21 
 
 
322 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2477  integrase family protein  50.96 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380932  normal  0.877994 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 
295 aa  125  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  27.97 
 
 
298 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  28.48 
 
 
302 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 
295 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 
295 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  30.82 
 
 
302 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.53 
 
 
302 aa  99.8  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  26.35 
 
 
295 aa  99  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  27.53 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  28.34 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.3 
 
 
303 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  29.47 
 
 
301 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  27 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.3 
 
 
303 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.84 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  25.42 
 
 
300 aa  97.1  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  29.68 
 
 
297 aa  96.7  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  25.77 
 
 
294 aa  95.9  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.85 
 
 
330 aa  95.9  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  27.61 
 
 
290 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  31.89 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  27.53 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.3 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.77 
 
 
300 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  30.74 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  30.43 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  28.62 
 
 
301 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  28.99 
 
 
295 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.8 
 
 
295 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  28.04 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  30.92 
 
 
317 aa  94  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.91 
 
 
315 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  32.88 
 
 
301 aa  93.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  25.41 
 
 
299 aa  93.2  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  29.73 
 
 
308 aa  92.8  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.92 
 
 
330 aa  92.4  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  34.24 
 
 
293 aa  92.4  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  30.59 
 
 
300 aa  92.4  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  28.13 
 
 
336 aa  92  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  26.85 
 
 
296 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  29 
 
 
300 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.77 
 
 
302 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  29.25 
 
 
300 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  25 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  30.35 
 
 
321 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  29.22 
 
 
300 aa  91.7  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  30.9 
 
 
295 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  24.27 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.39 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.3 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  31.07 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  26.13 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  26.2 
 
 
337 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  25.23 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.25 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1133  integrase family protein  30.14 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3433  phage integrase family protein  30.67 
 
 
345 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.48 
 
 
315 aa  90.9  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.48 
 
 
315 aa  90.9  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  29.9 
 
 
303 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  27.76 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  29.39 
 
 
300 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  33.66 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.67 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  28.34 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.92 
 
 
305 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  30.67 
 
 
294 aa  90.5  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.67 
 
 
300 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 
305 aa  90.5  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0052  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.02 
 
 
329 aa  90.1  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578512  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.3 
 
 
299 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  27.21 
 
 
294 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  28.96 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.95 
 
 
299 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  26.12 
 
 
295 aa  90.1  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.11 
 
 
296 aa  89.7  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  31.33 
 
 
298 aa  89.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  31.76 
 
 
309 aa  89.7  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.87 
 
 
311 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2996  tyrosine recombinase XerC  29.84 
 
 
323 aa  89.4  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3442  phage integrase  31.17 
 
 
337 aa  89.4  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  30 
 
 
328 aa  89.4  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  29.05 
 
 
300 aa  89.4  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  28.52 
 
 
332 aa  89.4  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  27.85 
 
 
301 aa  89.4  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.67 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.67 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.95 
 
 
299 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.95 
 
 
299 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  30.99 
 
 
309 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.95 
 
 
299 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  29.73 
 
 
302 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>